245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2015 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 514 aa  1007    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  65.74 
 
 		 517 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  63.96 
 
 		 505 aa  630  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  55.75 
 
 		 506 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  54.94 
 
 		 547 aa  544  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  51.86 
 
 		 508 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  51.47 
 
 		 508 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  51.47 
 
 		 508 aa  532  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  51.47 
 
 		 508 aa  532  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  51.47 
 
 		 508 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  51.27 
 
 		 508 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  51.27 
 
 		 508 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  51.27 
 
 		 508 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  51.99 
 
 		 508 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  51.27 
 
 		 508 aa  528  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  51.08 
 
 		 508 aa  527  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  53.73 
 
 		 547 aa  509  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  56.2 
 
 		 525 aa  507  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  53.62 
 
 		 520 aa  505  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  52.58 
 
 		 502 aa  500  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  47.25 
 
 		 502 aa  488  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  51.93 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  47.98 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  47.53 
 
 		 492 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  45.98 
 
 		 553 aa  442  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  44.95 
 
 		 510 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  44.04 
 
 		 497 aa  413  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  44.01 
 
 		 488 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  43.8 
 
 		 488 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  44 
 
 		 493 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  42.77 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  44.98 
 
 		 498 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  42.62 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  42.57 
 
 		 527 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  42.07 
 
 		 503 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  42.74 
 
 		 495 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  41.68 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  41.88 
 
 		 503 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  42.13 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  41.3 
 
 		 498 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  39.88 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  38.39 
 
 		 498 aa  347  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  39.52 
 
 		 499 aa  323  7e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  35.52 
 
 		 493 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  34.62 
 
 		 476 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  37.65 
 
 		 431 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.02 
 
 		 452 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  34.03 
 
 		 456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  34.7 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  33.2 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  29.87 
 
 		 461 aa  194  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  34.45 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  32.91 
 
 		 446 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  34.19 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  34.45 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  34.45 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  34.45 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  34.45 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.33 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  33.16 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  34.45 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  32.38 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  33.93 
 
 		 446 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  33.93 
 
 		 446 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1598  sodium:neurotransmitter symporter  32.98 
 
 		 486 aa  189  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  31.89 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  34.51 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 446 aa  187  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  31.24 
 
 		 454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  33.77 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  31.14 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  31.87 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  30.56 
 
 		 454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.13 
 
 		 468 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  30.93 
 
 		 486 aa  183  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  30.64 
 
 		 459 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  33.51 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  30.66 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  32.31 
 
 		 464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  34.81 
 
 		 443 aa  180  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  30.73 
 
 		 437 aa  179  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  32.09 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  29.49 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  31.3 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  27.21 
 
 		 458 aa  177  6e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.09 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  34.15 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  34.47 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  31.52 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  35.45 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  28.63 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  28.85 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  28.85 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  32.39 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  32.4 
 
 		 465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  31.68 
 
 		 455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  30.98 
 
 		 436 aa  173  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  28.33 
 
 		 454 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.38 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>