245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1274 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  100 
 
 		 448 aa  887    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  63.27 
 
 		 448 aa  581  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  56.24 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  53.47 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  55.43 
 
 		 454 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  55.65 
 
 		 454 aa  475  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  55.13 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  55.28 
 
 		 451 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  54.55 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  53.27 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  51.23 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  50.23 
 
 		 452 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  49.89 
 
 		 452 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  45.88 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0460  sodium:neurotransmitter symporter  48.95 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  45.66 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  45.66 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  45.88 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  45.88 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  45.5 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  40.04 
 
 		 455 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  35.38 
 
 		 473 aa  259  8e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  34.99 
 
 		 473 aa  253  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  36.71 
 
 		 474 aa  252  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  37.33 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  35.73 
 
 		 461 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  35.29 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  35.23 
 
 		 450 aa  236  6e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  35.51 
 
 		 443 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  38.33 
 
 		 475 aa  231  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.76 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  36.54 
 
 		 452 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.14 
 
 		 476 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  34.56 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.68 
 
 		 449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  37.28 
 
 		 454 aa  226  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.27 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  35.05 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  35.32 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  34.37 
 
 		 446 aa  222  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  34.37 
 
 		 446 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  34.58 
 
 		 446 aa  223  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  33.92 
 
 		 446 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  34.37 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  35.31 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  34.15 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  34.15 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  35.31 
 
 		 445 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  35.31 
 
 		 445 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  36.21 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  33.92 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  34.35 
 
 		 455 aa  219  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  36.34 
 
 		 456 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  33.92 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  33.92 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  35.31 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  35.09 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  35.31 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  35.31 
 
 		 445 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  34.87 
 
 		 445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  34.98 
 
 		 460 aa  216  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  36.88 
 
 		 452 aa  216  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  34.13 
 
 		 455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  32.53 
 
 		 470 aa  212  9e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  34.63 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.31 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  36.01 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  35.31 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  36.03 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  34.72 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  34.32 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  33.99 
 
 		 445 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  32.97 
 
 		 452 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  35.15 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  31.7 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  33.69 
 
 		 457 aa  206  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  34.34 
 
 		 454 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  35.24 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  35.53 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  34.83 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  33.41 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  35.07 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  33.18 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  31.78 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  35.42 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  36.49 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  35.42 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 		 488 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  36.49 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  33.68 
 
 		 465 aa  196  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  32.51 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 		 486 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  34.93 
 
 		 451 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  31.33 
 
 		 454 aa  192  7e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  34.93 
 
 		 452 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  35.15 
 
 		 452 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  29.18 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  35.15 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  32.68 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>