245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1949 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 455 aa  894    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  96.92 
 
 		 455 aa  871    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  63.86 
 
 		 453 aa  584  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  64.49 
 
 		 461 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  64.67 
 
 		 454 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  58.44 
 
 		 453 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  58.76 
 
 		 486 aa  512  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  58.67 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  54.1 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  49.21 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  48.11 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  41.39 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  41.89 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  42.44 
 
 		 452 aa  339  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  40.74 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  42.76 
 
 		 456 aa  332  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  41.18 
 
 		 454 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  41.81 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  39.64 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  39.64 
 
 		 446 aa  323  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  39.42 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  39.42 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  39.42 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  39.42 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  38.98 
 
 		 446 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  40.58 
 
 		 453 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  38.75 
 
 		 446 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  38.98 
 
 		 446 aa  315  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  39.78 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  38.75 
 
 		 446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  40.42 
 
 		 452 aa  312  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  37.75 
 
 		 470 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  43.2 
 
 		 443 aa  310  5e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  39.64 
 
 		 486 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  40.97 
 
 		 452 aa  309  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  38.24 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  41.77 
 
 		 469 aa  307  3e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  39.65 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  39.37 
 
 		 452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  36.97 
 
 		 446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  40.37 
 
 		 464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  42.32 
 
 		 475 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  35.98 
 
 		 450 aa  298  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  36.73 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.4 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  37.64 
 
 		 486 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  37.9 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  39.01 
 
 		 459 aa  292  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  38.62 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  38.36 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  38.39 
 
 		 445 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  38.51 
 
 		 445 aa  286  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  38.39 
 
 		 445 aa  285  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  38.39 
 
 		 445 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  38.84 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  38.84 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  38.84 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  40.49 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.95 
 
 		 445 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  40.64 
 
 		 448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  38.17 
 
 		 451 aa  282  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  38.58 
 
 		 447 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  38.67 
 
 		 447 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  38.58 
 
 		 452 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  37.69 
 
 		 452 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  36.34 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  37.69 
 
 		 452 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  37.92 
 
 		 452 aa  279  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  37.69 
 
 		 451 aa  279  8e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  37.92 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  33.33 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  37.24 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  36.7 
 
 		 461 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  37.29 
 
 		 468 aa  273  6e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  36.12 
 
 		 470 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  35.73 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  37.92 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  38.24 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  35.38 
 
 		 484 aa  270  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  38.16 
 
 		 455 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  37.47 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  34 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  34.44 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  35.37 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  35.37 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  33.33 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  36.83 
 
 		 451 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  35.48 
 
 		 463 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  35.82 
 
 		 450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  38.65 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  34.51 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.38 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.4 
 
 		 450 aa  257  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  35.57 
 
 		 457 aa  256  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  33.72 
 
 		 447 aa  256  7e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  33.72 
 
 		 447 aa  256  7e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  34.83 
 
 		 467 aa  255  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  35.73 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  35.62 
 
 		 478 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  37.22 
 
 		 467 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>