246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0963 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  73.67 
 
 		 452 aa  669    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 452 aa  886    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  56.29 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  57.11 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  59.02 
 
 		 453 aa  485  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  53.14 
 
 		 457 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  54.34 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  53.1 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  56.28 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  52 
 
 		 452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  53.42 
 
 		 446 aa  465  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  50.78 
 
 		 450 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  50.56 
 
 		 450 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  50.67 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  54 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  54.09 
 
 		 467 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  50.54 
 
 		 467 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  49.67 
 
 		 478 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  50.79 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  50.76 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  53.73 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  49.67 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  48.9 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  48.68 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  47.12 
 
 		 486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  48.33 
 
 		 486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  48.1 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  48.57 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  45.54 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  41.93 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  41.7 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  42.15 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  41.7 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  42.15 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  41.93 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  42.15 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  45.54 
 
 		 452 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  41.7 
 
 		 446 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  45.75 
 
 		 468 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  41.7 
 
 		 446 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  41.93 
 
 		 446 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  41.48 
 
 		 446 aa  362  9e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  47.28 
 
 		 459 aa  361  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  45.17 
 
 		 463 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  46.34 
 
 		 453 aa  355  6.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  43.21 
 
 		 476 aa  352  7e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  43.05 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  42.34 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  43.92 
 
 		 463 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  43.12 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  40.97 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  43.61 
 
 		 456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  41.19 
 
 		 455 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  45.12 
 
 		 446 aa  342  7e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  44.8 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  43.61 
 
 		 461 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  39.22 
 
 		 456 aa  319  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  37.8 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  44.24 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  41.87 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  41.32 
 
 		 452 aa  310  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  40.91 
 
 		 454 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  41.32 
 
 		 452 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  39.47 
 
 		 465 aa  310  4e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  41.32 
 
 		 452 aa  310  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  41.48 
 
 		 451 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  41.32 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  41.48 
 
 		 451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  41.1 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  44.1 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  39.64 
 
 		 459 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  41.32 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  41.16 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  41.16 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  43.71 
 
 		 468 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  43.71 
 
 		 486 aa  300  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  35.37 
 
 		 454 aa  299  8e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  41.16 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  40.94 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  41.16 
 
 		 445 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  40.49 
 
 		 445 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  41.19 
 
 		 452 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  40.94 
 
 		 445 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  44.15 
 
 		 448 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  40.88 
 
 		 452 aa  296  7e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  40.94 
 
 		 445 aa  295  9e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  40.94 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  37.94 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  40.76 
 
 		 447 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  36.24 
 
 		 446 aa  292  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  36.24 
 
 		 446 aa  292  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  40.89 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  37.08 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  40.78 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  38.05 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  36.85 
 
 		 469 aa  286  4e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  37.86 
 
 		 483 aa  285  8e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  32.67 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  37.87 
 
 		 444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  33.18 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>