245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2371 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  100 
 
 		 453 aa  890    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  68.05 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  67.26 
 
 		 453 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  58.89 
 
 		 455 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  58.44 
 
 		 455 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  64.11 
 
 		 461 aa  535  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  59.91 
 
 		 468 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  59.69 
 
 		 486 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  55.68 
 
 		 460 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  51.63 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  46.65 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  43.69 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  44.52 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  40.72 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  40.49 
 
 		 446 aa  342  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  40.49 
 
 		 446 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  43.6 
 
 		 454 aa  342  8e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  40.49 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  40.27 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  40.49 
 
 		 446 aa  340  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  40.04 
 
 		 446 aa  338  9e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  40.04 
 
 		 446 aa  338  9e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  40.04 
 
 		 446 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  43.94 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  40.04 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  39.37 
 
 		 446 aa  335  9e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  43.15 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  39.87 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  40.71 
 
 		 452 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  41.89 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  44.64 
 
 		 475 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  41.44 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  40.53 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  40.18 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  43.05 
 
 		 452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  37.86 
 
 		 453 aa  312  5.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  39.82 
 
 		 453 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  40.44 
 
 		 468 aa  312  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  39.34 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  39.87 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  41.4 
 
 		 486 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  39.02 
 
 		 446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  40.36 
 
 		 445 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  41.87 
 
 		 443 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.94 
 
 		 455 aa  302  9e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  40.36 
 
 		 445 aa  302  9e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  40.14 
 
 		 445 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  40.14 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  40.36 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  39.91 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  40.36 
 
 		 445 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  40.36 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  36.92 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  40.14 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  38.39 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  40.09 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  37.93 
 
 		 457 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  39.73 
 
 		 447 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  39.07 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  38.05 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  38.05 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  38.05 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  38.05 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  38.27 
 
 		 452 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  38.46 
 
 		 486 aa  292  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  38.05 
 
 		 452 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  40 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  37.83 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  35.93 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  38.27 
 
 		 452 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  38.12 
 
 		 461 aa  285  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  38.05 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  39.61 
 
 		 455 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  38.05 
 
 		 452 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  36.83 
 
 		 446 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  36.83 
 
 		 446 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  38.05 
 
 		 451 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  40 
 
 		 459 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  35.96 
 
 		 469 aa  281  2e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  36.91 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  35.52 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  36.87 
 
 		 447 aa  272  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  34.14 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  35.15 
 
 		 484 aa  270  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  34.73 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  38.08 
 
 		 478 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  34.51 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  37 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  36.55 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  33.33 
 
 		 454 aa  263  4e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  36.64 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  34.18 
 
 		 468 aa  262  8.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  36.21 
 
 		 483 aa  262  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  35.7 
 
 		 467 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  37.86 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  36.34 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  35.31 
 
 		 470 aa  256  8e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  40.9 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  39.29 
 
 		 467 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  33.02 
 
 		 447 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>