245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1157 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
452 aa  888    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  54.08 
 
 
470 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  53.15 
 
 
457 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  52.61 
 
 
452 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  53.14 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  51.24 
 
 
450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  50.9 
 
 
464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  51.25 
 
 
450 aa  442  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  50.46 
 
 
446 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  50.76 
 
 
478 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  50.98 
 
 
467 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  51.24 
 
 
466 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  52 
 
 
452 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  50.22 
 
 
461 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  50.78 
 
 
453 aa  437  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  49.44 
 
 
486 aa  434  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  50.11 
 
 
486 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  51.56 
 
 
455 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  52.94 
 
 
467 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  50.76 
 
 
467 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  47.75 
 
 
452 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  46.44 
 
 
461 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  48.41 
 
 
453 aa  388  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  47.25 
 
 
451 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  44.8 
 
 
450 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  44.57 
 
 
449 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  45.58 
 
 
454 aa  362  9e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  46.67 
 
 
459 aa  361  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  42.82 
 
 
457 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  43.94 
 
 
453 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  41.57 
 
 
452 aa  345  8e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  43.47 
 
 
452 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  43.94 
 
 
446 aa  342  8e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  43.44 
 
 
453 aa  338  9e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  44.42 
 
 
453 aa  332  9e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  38.6 
 
 
463 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  44.4 
 
 
468 aa  325  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  40.98 
 
 
453 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  40.5 
 
 
446 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  40.95 
 
 
446 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  40.5 
 
 
446 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  42.33 
 
 
463 aa  322  6e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  40.42 
 
 
455 aa  322  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  40.42 
 
 
455 aa  322  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  40.41 
 
 
446 aa  322  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  40.64 
 
 
446 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  40.72 
 
 
446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  39.95 
 
 
446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  40.5 
 
 
446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  40.5 
 
 
446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  40.5 
 
 
446 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  41.47 
 
 
465 aa  317  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  40.18 
 
 
446 aa  315  8e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  40.31 
 
 
476 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  42.06 
 
 
449 aa  307  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  40.23 
 
 
450 aa  305  8.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  40.73 
 
 
456 aa  302  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  40.92 
 
 
456 aa  302  9e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  37.3 
 
 
459 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  43.18 
 
 
461 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  40.53 
 
 
454 aa  299  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  36.53 
 
 
454 aa  296  4e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  38.62 
 
 
447 aa  293  5e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  42.44 
 
 
475 aa  293  5e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  41.53 
 
 
452 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  41.53 
 
 
452 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  39.68 
 
 
445 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  39.91 
 
 
445 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  39.91 
 
 
445 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  39.68 
 
 
445 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  41.53 
 
 
451 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  41.53 
 
 
451 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  41.53 
 
 
452 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  39.68 
 
 
445 aa  289  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  41.53 
 
 
452 aa  289  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  39.46 
 
 
445 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  39.46 
 
 
445 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  41.31 
 
 
452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  39.23 
 
 
445 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  35.19 
 
 
454 aa  286  8e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  41.74 
 
 
444 aa  286  8e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  39.73 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  34 
 
 
454 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  42.06 
 
 
448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  39.46 
 
 
445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  35.59 
 
 
458 aa  281  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  41.53 
 
 
452 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  41.99 
 
 
452 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  40.69 
 
 
460 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  41.99 
 
 
452 aa  279  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  42.4 
 
 
468 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  39.05 
 
 
447 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  43.77 
 
 
486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  41.48 
 
 
451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  37.56 
 
 
450 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  36.26 
 
 
457 aa  271  1e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  39.13 
 
 
455 aa  270  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  34.7 
 
 
447 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  34.7 
 
 
447 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  37.25 
 
 
443 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>