245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2297 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  100 
 
 		 461 aa  907    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  51.56 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  51 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  50 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  45.43 
 
 		 486 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  50.89 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  47.92 
 
 		 486 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  48.81 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  48.09 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  49.78 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  44.86 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  50.76 
 
 		 452 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  48.16 
 
 		 452 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  44.86 
 
 		 450 aa  396  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  44.35 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  45.88 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  47.52 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  44.89 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  45.19 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  45.84 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  47.38 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  44.68 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  45.22 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  44.06 
 
 		 454 aa  361  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  45.34 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  45.94 
 
 		 467 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  45.09 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  44.12 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  42.08 
 
 		 457 aa  343  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  43.68 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  42.57 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  38.43 
 
 		 452 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  38.6 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  37.94 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  39.52 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  38.05 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  37.72 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  37.94 
 
 		 446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  37.94 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  37.5 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  37.5 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  37.72 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  37.72 
 
 		 446 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  37.61 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  40.13 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  37.69 
 
 		 465 aa  298  9e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  37.5 
 
 		 446 aa  299  9e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  37.01 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  39.16 
 
 		 468 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  39.22 
 
 		 455 aa  292  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  40.18 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  36.21 
 
 		 456 aa  289  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  38.58 
 
 		 455 aa  289  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  39.45 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  38.36 
 
 		 476 aa  286  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  37.86 
 
 		 447 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  37.86 
 
 		 446 aa  283  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  39.14 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  38.03 
 
 		 454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  35.27 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  37.47 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  38.02 
 
 		 460 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.12 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  36.78 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  36.9 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  37.12 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  37.34 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  36.9 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  37.34 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  38.46 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  36.44 
 
 		 450 aa  260  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  38.48 
 
 		 475 aa  260  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  37.2 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  36.68 
 
 		 445 aa  259  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  37.39 
 
 		 447 aa  259  9e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  32.53 
 
 		 454 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  35.41 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  37.34 
 
 		 445 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  31.52 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  38.35 
 
 		 443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  37.04 
 
 		 447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  37.12 
 
 		 452 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  37.12 
 
 		 452 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  37.12 
 
 		 451 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  31.19 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  36.65 
 
 		 486 aa  250  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  36.65 
 
 		 468 aa  250  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1200  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  36.36 
 
 		 450 aa  249  5e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.332542  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  36.9 
 
 		 452 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  36.68 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  36.9 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  35.13 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  36.68 
 
 		 452 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  38.3 
 
 		 448 aa  246  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  35.97 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  35.43 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1198  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  35.46 
 
 		 444 aa  243  7e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  34.07 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  32.23 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  37.34 
 
 		 452 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>