245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1199 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  100 
 
 
445 aa  865    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1200  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  78.67 
 
 
450 aa  643    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.332542  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  66.82 
 
 
444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  66.14 
 
 
444 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  66.59 
 
 
444 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  63.51 
 
 
448 aa  549  1e-155  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  60.63 
 
 
444 aa  548  1e-154  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  61.26 
 
 
448 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1292  sodium- and chloride-dependent transporter  60.49 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.889918  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  56.18 
 
 
447 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1198  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  59.23 
 
 
444 aa  478  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  56.66 
 
 
450 aa  473  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0530  sodium- and chloride-dependent transporter  55.56 
 
 
445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0959  ModE family transcriptional regulator  51.69 
 
 
443 aa  434  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.167837  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1504  sodium/neurotransmitter symporter family protein  50.79 
 
 
443 aa  425  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1012  sodium transporter, putative  51.69 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0880  putative sodium transporter  51.91 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0426981  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0941  sodium transporter, putative  51.69 
 
 
446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  38.83 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  37.39 
 
 
464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  37.92 
 
 
486 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  38.18 
 
 
446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  38.18 
 
 
446 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  38.18 
 
 
446 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  38.18 
 
 
446 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  38.41 
 
 
446 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  38.18 
 
 
446 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  38.18 
 
 
446 aa  269  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  37.95 
 
 
446 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  37.41 
 
 
453 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  38.18 
 
 
446 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  38.18 
 
 
446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  36.83 
 
 
464 aa  264  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  35.41 
 
 
461 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  39.68 
 
 
445 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  36.97 
 
 
454 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  36.41 
 
 
452 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  35.14 
 
 
452 aa  260  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  39.45 
 
 
445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  37.02 
 
 
453 aa  259  6e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  39.22 
 
 
445 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  39.45 
 
 
445 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  39.22 
 
 
445 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  39.45 
 
 
445 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  39.22 
 
 
445 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  38.99 
 
 
445 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  36.82 
 
 
446 aa  256  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  39.27 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  38.99 
 
 
445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  35.54 
 
 
450 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  35.54 
 
 
450 aa  251  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  38.81 
 
 
447 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 
459 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  34.83 
 
 
452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  34.31 
 
 
486 aa  243  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  34.16 
 
 
455 aa  242  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  35.11 
 
 
452 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  33.56 
 
 
446 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  36.18 
 
 
457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.63 
 
 
449 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.79 
 
 
452 aa  240  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  37.72 
 
 
468 aa  240  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  33.71 
 
 
455 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  35.49 
 
 
455 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  36.67 
 
 
461 aa  236  7e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  35.28 
 
 
451 aa  233  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  39.91 
 
 
452 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  39.91 
 
 
451 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  35.73 
 
 
453 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  39.45 
 
 
452 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  34.53 
 
 
457 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  39.22 
 
 
452 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  34.62 
 
 
466 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  39.22 
 
 
452 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  39.22 
 
 
452 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  39.22 
 
 
451 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  31.59 
 
 
476 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  32.95 
 
 
456 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  31.18 
 
 
453 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  33.48 
 
 
450 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  39.45 
 
 
452 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  33.56 
 
 
443 aa  218  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  39.45 
 
 
452 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  39.68 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  33.41 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  39.82 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  30.82 
 
 
458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.56 
 
 
454 aa  213  7.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
446 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
446 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  32.47 
 
 
467 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  32.65 
 
 
463 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  34.9 
 
 
475 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  32.75 
 
 
446 aa  209  9e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 
456 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  32.14 
 
 
448 aa  208  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  32.98 
 
 
478 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  31.65 
 
 
461 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  33.93 
 
 
465 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 
453 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>