246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1490 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
486 aa  959    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  63.35 
 
 
486 aa  616  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  54.05 
 
 
464 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  52.21 
 
 
466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  48.35 
 
 
470 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  49.44 
 
 
452 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  45 
 
 
461 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  47.78 
 
 
457 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  46.22 
 
 
453 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  45.31 
 
 
450 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  44.87 
 
 
450 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  46.99 
 
 
452 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  47.18 
 
 
446 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  45.31 
 
 
464 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  47.12 
 
 
452 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  48.44 
 
 
453 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  46.1 
 
 
452 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  47.48 
 
 
467 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  43.67 
 
 
454 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  44.96 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  44.64 
 
 
461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  43.48 
 
 
467 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  42.54 
 
 
451 aa  354  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  44.71 
 
 
478 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  41.94 
 
 
457 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  40.4 
 
 
452 aa  340  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  41.72 
 
 
450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  41.5 
 
 
449 aa  336  5.999999999999999e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  44.42 
 
 
467 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  41.8 
 
 
463 aa  320  5e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  39.73 
 
 
463 aa  313  5.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  42.54 
 
 
453 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  40.39 
 
 
459 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  38.08 
 
 
453 aa  307  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  38.2 
 
 
445 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  39.29 
 
 
449 aa  296  4e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  34.52 
 
 
446 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  37.98 
 
 
445 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  34.52 
 
 
446 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  37.98 
 
 
445 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  34.16 
 
 
446 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  37.98 
 
 
445 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  37.64 
 
 
455 aa  296  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  34.74 
 
 
446 aa  296  8e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.98 
 
 
445 aa  295  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  34.52 
 
 
446 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  38.1 
 
 
455 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  38.43 
 
 
445 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  34.08 
 
 
446 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  38.43 
 
 
445 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  38.43 
 
 
445 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  34 
 
 
446 aa  292  7e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  38.46 
 
 
453 aa  292  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  38.17 
 
 
447 aa  292  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  33.56 
 
 
446 aa  292  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 
446 aa  292  9e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  33.85 
 
 
446 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  39.41 
 
 
446 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  34.08 
 
 
446 aa  291  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  38.2 
 
 
445 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  39.06 
 
 
476 aa  289  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  36.82 
 
 
456 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  39.91 
 
 
468 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  38.26 
 
 
447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  40.04 
 
 
475 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  36.47 
 
 
450 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  37.78 
 
 
465 aa  279  8e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  38.76 
 
 
460 aa  279  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  35.48 
 
 
459 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  39.21 
 
 
456 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  37.61 
 
 
452 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  38.55 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  37.13 
 
 
444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  36.3 
 
 
453 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  36.12 
 
 
443 aa  268  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  37.27 
 
 
444 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  37.05 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  37.27 
 
 
444 aa  267  4e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  30.67 
 
 
454 aa  266  8.999999999999999e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  36.54 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  36.54 
 
 
452 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  36.54 
 
 
451 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  36.54 
 
 
452 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  33.92 
 
 
446 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  33.92 
 
 
446 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  40.14 
 
 
486 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  40.14 
 
 
468 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  37.92 
 
 
445 aa  261  3e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  36.32 
 
 
451 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  36.54 
 
 
452 aa  260  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  31.42 
 
 
454 aa  259  6e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  36.11 
 
 
452 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  40.4 
 
 
448 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  37.99 
 
 
461 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.22 
 
 
450 aa  256  6e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  36.66 
 
 
455 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  30.87 
 
 
454 aa  254  3e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  33.41 
 
 
447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  37.06 
 
 
470 aa  253  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  35.89 
 
 
452 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>