245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2107 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 461 aa  902    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  64.49 
 
 		 455 aa  592  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  63.56 
 
 		 455 aa  588  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  68.63 
 
 		 486 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  70.25 
 
 		 468 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  64.11 
 
 		 453 aa  567  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  63.23 
 
 		 453 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  62.93 
 
 		 454 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  49.34 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  47.77 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  49.01 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  42.47 
 
 		 452 aa  333  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  41.53 
 
 		 449 aa  329  6e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  42.99 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  40.67 
 
 		 452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  41.29 
 
 		 454 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  43.61 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  38.26 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  40.4 
 
 		 470 aa  303  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  40.5 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  38.1 
 
 		 446 aa  299  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  38.65 
 
 		 476 aa  299  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  37.87 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  37.87 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  37.87 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  37.41 
 
 		 446 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  39.61 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  38.76 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  38.13 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  39.61 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  37.78 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  40.04 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  37.3 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  36.96 
 
 		 446 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  37.19 
 
 		 446 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  37.56 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  41.96 
 
 		 475 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  39.02 
 
 		 446 aa  289  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  38.44 
 
 		 466 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  39.77 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  39.74 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  40.94 
 
 		 443 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  40.31 
 
 		 459 aa  279  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  41.34 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  37.32 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  37.83 
 
 		 469 aa  276  8e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  37.8 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  37.74 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  36.1 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  35.87 
 
 		 450 aa  273  7e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  37.99 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  40.66 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  37.39 
 
 		 451 aa  266  7e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.02 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  36.2 
 
 		 450 aa  263  6.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  37.53 
 
 		 452 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  37.53 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  38.84 
 
 		 461 aa  262  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  37.53 
 
 		 452 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  37.87 
 
 		 445 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  37.35 
 
 		 451 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  37.53 
 
 		 452 aa  261  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  40.59 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  37.13 
 
 		 457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.64 
 
 		 445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  35.62 
 
 		 447 aa  259  6e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  33.48 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.21 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  37.21 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  37.21 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  36.77 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  37.21 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  37.21 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  37.21 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  37.21 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  37.98 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  37.32 
 
 		 452 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  37.87 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  34.64 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  37.53 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  33.99 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  34.62 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  36.42 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  37.05 
 
 		 447 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.99 
 
 		 449 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  37.08 
 
 		 444 aa  251  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  36.3 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  36.83 
 
 		 452 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  38.53 
 
 		 446 aa  250  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  34.01 
 
 		 446 aa  249  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  34.01 
 
 		 446 aa  249  9e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  35.79 
 
 		 463 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  36.83 
 
 		 452 aa  246  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  37.72 
 
 		 478 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  33.96 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  33.96 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  37.09 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  35.34 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  37.93 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  36.61 
 
 		 467 aa  242  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>