245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0741 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
463 aa  896    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  45.33 
 
 
461 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  45.92 
 
 
470 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  44.97 
 
 
464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  43.6 
 
 
452 aa  343  5e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  41.52 
 
 
446 aa  333  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  43.02 
 
 
464 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  44.59 
 
 
452 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  42.89 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  41.29 
 
 
466 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  38.6 
 
 
452 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  41.8 
 
 
486 aa  320  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  40.36 
 
 
457 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  40.35 
 
 
486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  38.07 
 
 
453 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  43.79 
 
 
453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  37.02 
 
 
450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  37.44 
 
 
451 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  36.57 
 
 
450 aa  301  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  40.09 
 
 
457 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  39.91 
 
 
461 aa  293  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  38.44 
 
 
452 aa  293  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  39.51 
 
 
454 aa  292  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  39.82 
 
 
468 aa  290  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  38.53 
 
 
455 aa  277  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  38.01 
 
 
467 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  36.75 
 
 
465 aa  274  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  36.26 
 
 
450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  39.46 
 
 
463 aa  273  7e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  38.23 
 
 
478 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.81 
 
 
449 aa  269  8.999999999999999e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  39.86 
 
 
453 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  36.98 
 
 
459 aa  265  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  39.05 
 
 
467 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  34.67 
 
 
456 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  38.27 
 
 
446 aa  262  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  35.48 
 
 
455 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  34.8 
 
 
453 aa  259  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.25 
 
 
455 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  36.34 
 
 
453 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  38.41 
 
 
467 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.01 
 
 
476 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  37.68 
 
 
453 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.7 
 
 
456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  34.4 
 
 
450 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  35.02 
 
 
452 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  33.93 
 
 
459 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  36.41 
 
 
454 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  34.6 
 
 
460 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  35.79 
 
 
461 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  35.14 
 
 
449 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  30.31 
 
 
446 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  30.75 
 
 
446 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  30.31 
 
 
446 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  30.53 
 
 
446 aa  224  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  30.75 
 
 
446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  30.09 
 
 
446 aa  223  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  30.53 
 
 
446 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  30.53 
 
 
446 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  36.67 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  36.67 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  34.5 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  30.31 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  28.04 
 
 
454 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  33.7 
 
 
475 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  29.87 
 
 
446 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  32.02 
 
 
443 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  29.58 
 
 
446 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  31.25 
 
 
447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  31.25 
 
 
447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  27.35 
 
 
454 aa  216  8e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  27.86 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  27.96 
 
 
458 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  30.94 
 
 
447 aa  213  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  30.84 
 
 
457 aa  212  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  29.98 
 
 
484 aa  212  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  35.39 
 
 
448 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  32.46 
 
 
450 aa  209  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  35.92 
 
 
451 aa  207  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  32.27 
 
 
447 aa  207  5e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 
455 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  33.97 
 
 
483 aa  206  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  28.95 
 
 
461 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  30.73 
 
 
469 aa  204  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  32.02 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  34.76 
 
 
431 aa  196  6e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  30.75 
 
 
444 aa  195  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  28.19 
 
 
458 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0404  sodium:neurotransmitter symporter  30.04 
 
 
463 aa  194  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.630301  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  33.26 
 
 
445 aa  193  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  32.46 
 
 
445 aa  192  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  30 
 
 
462 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0801  sodium:neurotransmitter symporter  30.13 
 
 
461 aa  192  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  32.46 
 
 
445 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  32.24 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  32.24 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  33.95 
 
 
457 aa  190  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  32.24 
 
 
445 aa  190  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  32.24 
 
 
445 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  31.88 
 
 
447 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>