245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2112 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 455 aa  887    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  44.91 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  47.9 
 
 		 449 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  46 
 
 		 453 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  48.8 
 
 		 475 aa  359  5e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  46.58 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  46.48 
 
 		 454 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  46.77 
 
 		 468 aa  348  8e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  42.13 
 
 		 446 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  48.48 
 
 		 448 aa  336  5e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  39.91 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  44.19 
 
 		 459 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  41.15 
 
 		 446 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  41.15 
 
 		 446 aa  329  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  41.15 
 
 		 446 aa  329  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  41.15 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  40.93 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  40.93 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  40.71 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  40.93 
 
 		 446 aa  325  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  40.71 
 
 		 446 aa  325  9e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  40.71 
 
 		 446 aa  325  9e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  42.76 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  38.94 
 
 		 453 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  43.45 
 
 		 453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  41.21 
 
 		 455 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  40.13 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  40.49 
 
 		 455 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  38.04 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  40.4 
 
 		 460 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  42.47 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  38.24 
 
 		 470 aa  299  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  39.21 
 
 		 452 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  40.98 
 
 		 445 aa  296  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  40.76 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  40.76 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  40.53 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  40.53 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  40.53 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  40.79 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  40.53 
 
 		 445 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  40.53 
 
 		 445 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  39.91 
 
 		 486 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  36.99 
 
 		 450 aa  290  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  40.31 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  40.35 
 
 		 447 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  39.13 
 
 		 452 aa  289  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  37.61 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  39.34 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  40.78 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  39.56 
 
 		 454 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  41.52 
 
 		 464 aa  286  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  36.7 
 
 		 451 aa  285  9e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  40.35 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  39.87 
 
 		 452 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  38.15 
 
 		 457 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  39.51 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  39.51 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  39.51 
 
 		 451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  39.74 
 
 		 451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  39.51 
 
 		 452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  39.51 
 
 		 452 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  40.04 
 
 		 448 aa  282  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  37.12 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  37.42 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  39.74 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  38.26 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  36.62 
 
 		 483 aa  279  6e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  35.41 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  40.17 
 
 		 473 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  39.29 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  36.83 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  35.85 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  40.17 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  38.51 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  42.46 
 
 		 455 aa  276  4e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  36.77 
 
 		 448 aa  276  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  38.84 
 
 		 488 aa  276  5e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  33.41 
 
 		 454 aa  276  7e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  39.51 
 
 		 452 aa  276  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  39.51 
 
 		 452 aa  275  9e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  40.48 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  38.03 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  36.93 
 
 		 469 aa  273  6e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  34.26 
 
 		 454 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  39.51 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  37.97 
 
 		 473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  35.76 
 
 		 461 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  37.31 
 
 		 464 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  37.53 
 
 		 470 aa  269  5.9999999999999995e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  39.21 
 
 		 453 aa  269  8e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  42.13 
 
 		 431 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  37.82 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  39.18 
 
 		 461 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  36.88 
 
 		 461 aa  266  5e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  38.02 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  39.17 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  38.54 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  39.08 
 
 		 451 aa  264  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  38.68 
 
 		 448 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>