245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0271 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  100 
 
 
463 aa  920    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  46.21 
 
 
464 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  44.07 
 
 
470 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  45.05 
 
 
452 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  42.13 
 
 
461 aa  358  9e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  42.13 
 
 
466 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  42.95 
 
 
464 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  43.92 
 
 
452 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  42.33 
 
 
452 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  40.45 
 
 
486 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  41.35 
 
 
451 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  41.22 
 
 
452 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  39.73 
 
 
486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  40.32 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  40.77 
 
 
457 aa  337  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  39.5 
 
 
457 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  37.89 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  38.1 
 
 
450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  38.55 
 
 
450 aa  320  3e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  42.34 
 
 
453 aa  320  5e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  42.79 
 
 
455 aa  316  7e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  41.46 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  39.65 
 
 
450 aa  311  2e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  41.89 
 
 
467 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  39.6 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  39.95 
 
 
446 aa  303  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  39.46 
 
 
463 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  39.55 
 
 
454 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  40.98 
 
 
467 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  40.85 
 
 
478 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.29 
 
 
452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  40.09 
 
 
453 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  38.55 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  38.15 
 
 
450 aa  283  6.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.59 
 
 
455 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  35.37 
 
 
455 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  37.22 
 
 
459 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  41.08 
 
 
467 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  37.5 
 
 
459 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  38.03 
 
 
443 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  33.48 
 
 
446 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  33.7 
 
 
446 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  33.71 
 
 
446 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
446 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  36.7 
 
 
465 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  33.71 
 
 
446 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  33.71 
 
 
446 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  33.92 
 
 
446 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  33.71 
 
 
446 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  33.92 
 
 
446 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  38.06 
 
 
452 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  33.48 
 
 
446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  35.35 
 
 
456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.7 
 
 
453 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  33.48 
 
 
446 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 
453 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  35.45 
 
 
454 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  35.14 
 
 
453 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  33.92 
 
 
447 aa  256  6e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.02 
 
 
455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  38.11 
 
 
475 aa  253  7e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  35.92 
 
 
468 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.63 
 
 
449 aa  250  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  32.74 
 
 
446 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  32.74 
 
 
446 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  31.08 
 
 
454 aa  245  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  31.95 
 
 
454 aa  243  5e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  37.81 
 
 
468 aa  240  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  33.87 
 
 
469 aa  240  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  37.81 
 
 
486 aa  240  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  33.56 
 
 
450 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  32.44 
 
 
476 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  37.53 
 
 
461 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  37.44 
 
 
448 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  35.03 
 
 
460 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  34.24 
 
 
444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  32.49 
 
 
457 aa  236  6e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  32.02 
 
 
454 aa  236  7e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  32.41 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  29.93 
 
 
458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  32.33 
 
 
470 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  31.5 
 
 
443 aa  231  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  32.58 
 
 
445 aa  230  3e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  32.19 
 
 
458 aa  231  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  33.33 
 
 
483 aa  230  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  36.14 
 
 
446 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  32.65 
 
 
456 aa  229  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  33.93 
 
 
445 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  32.18 
 
 
447 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  32.18 
 
 
447 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0092  sodium-dependent transporter, putative  33.26 
 
 
442 aa  228  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  31.28 
 
 
444 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.88 
 
 
448 aa  227  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  31.28 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  31.28 
 
 
444 aa  226  9e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  32.96 
 
 
445 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  31.72 
 
 
447 aa  225  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  32.74 
 
 
445 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  32.74 
 
 
445 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  32.74 
 
 
445 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>