245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2879 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  68.52 
 
 
464 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
470 aa  915    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  55.41 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  53.96 
 
 
450 aa  488  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  54.26 
 
 
464 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  55.51 
 
 
446 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  52.54 
 
 
450 aa  481  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  53.06 
 
 
453 aa  476  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  54.08 
 
 
452 aa  477  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  55 
 
 
466 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  57.08 
 
 
455 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  53.33 
 
 
457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  56.29 
 
 
452 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  52.6 
 
 
452 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  51.56 
 
 
461 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  52.04 
 
 
451 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  48.35 
 
 
486 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  51.94 
 
 
461 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  49.55 
 
 
486 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  53.38 
 
 
467 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  48.25 
 
 
467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  52.46 
 
 
453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  47.82 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  47.43 
 
 
457 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  49.67 
 
 
454 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  48.03 
 
 
467 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  47.21 
 
 
459 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  47.26 
 
 
468 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  47.19 
 
 
450 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  45.92 
 
 
463 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  43.84 
 
 
452 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  46.97 
 
 
449 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  46.59 
 
 
453 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  44.13 
 
 
453 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  45.96 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  43.93 
 
 
476 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  44.07 
 
 
463 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  44.29 
 
 
456 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  41.15 
 
 
446 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  41.15 
 
 
446 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  41.37 
 
 
446 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  41.37 
 
 
446 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  40.71 
 
 
446 aa  339  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  40.93 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  40 
 
 
446 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  40.93 
 
 
446 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  40.71 
 
 
446 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  40.93 
 
 
446 aa  335  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  40.71 
 
 
446 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  43.08 
 
 
452 aa  330  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  43.51 
 
 
465 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  40.89 
 
 
450 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  40.53 
 
 
453 aa  316  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  44.52 
 
 
475 aa  311  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  37.75 
 
 
455 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  38.77 
 
 
455 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  39.78 
 
 
459 aa  309  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  42.86 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  41.24 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  38.19 
 
 
453 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  39.17 
 
 
456 aa  295  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  38.69 
 
 
454 aa  292  7e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  41.54 
 
 
447 aa  291  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  37.64 
 
 
447 aa  289  9e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  40.49 
 
 
445 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  35.67 
 
 
454 aa  288  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  40.49 
 
 
445 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  40.49 
 
 
445 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  40.49 
 
 
445 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  40.27 
 
 
445 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  38.95 
 
 
460 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  40.49 
 
 
445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  40.27 
 
 
445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  35.21 
 
 
454 aa  286  5.999999999999999e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  40.04 
 
 
445 aa  286  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  36.91 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  36.91 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  40.36 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  40.36 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  40.36 
 
 
452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  40.13 
 
 
445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  40.13 
 
 
452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  40.13 
 
 
451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  40.13 
 
 
452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  39.41 
 
 
468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  39.41 
 
 
486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  40.13 
 
 
452 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  40.31 
 
 
447 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  40.4 
 
 
461 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  36.47 
 
 
447 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  37.78 
 
 
450 aa  280  4e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  37.92 
 
 
470 aa  280  4e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  34.13 
 
 
454 aa  278  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  35.98 
 
 
446 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  35.98 
 
 
446 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  38.83 
 
 
445 aa  277  3e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  44.74 
 
 
448 aa  275  9e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  40.83 
 
 
457 aa  275  9e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  34.29 
 
 
458 aa  274  3e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  38.57 
 
 
444 aa  274  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>