245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1525 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  100 
 
 		 450 aa  878    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  98 
 
 		 450 aa  867    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  72.44 
 
 		 453 aa  674    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  60.91 
 
 		 446 aa  568  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  52.54 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  55.6 
 
 		 455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  50.56 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  52.13 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  51.25 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  50.78 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  46.19 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  45.31 
 
 		 486 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  44.64 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  45.76 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  48.08 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  44.77 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  42.92 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  44.12 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  45.73 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  43.15 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  44.94 
 
 		 454 aa  364  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  45.74 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  41.42 
 
 		 478 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  42.79 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  41.89 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  42.27 
 
 		 467 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  42.47 
 
 		 452 aa  346  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  44.52 
 
 		 450 aa  343  5e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  42.6 
 
 		 468 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  44.52 
 
 		 449 aa  339  5.9999999999999996e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  42.67 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  40.4 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  40.32 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  40.58 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  40.36 
 
 		 446 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  40.13 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  40.13 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  40.72 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  40.36 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  40.13 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  43.24 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  40.36 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  40.36 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  40.58 
 
 		 446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  38.78 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  40.36 
 
 		 446 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  39.91 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  40.59 
 
 		 452 aa  306  7e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  40.6 
 
 		 456 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  37.02 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  38.39 
 
 		 453 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  36.95 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  39.6 
 
 		 449 aa  297  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  36.73 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  37.78 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  38.55 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  35.48 
 
 		 458 aa  281  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  39.5 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  36.43 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  39.73 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  39.5 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  39.5 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  39.73 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  39.28 
 
 		 445 aa  279  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  39.28 
 
 		 445 aa  279  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  35.23 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  39.5 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  36.42 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  37.78 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  35.03 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  37.78 
 
 		 486 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  37.23 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  38.6 
 
 		 445 aa  274  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  37.18 
 
 		 470 aa  273  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  38.88 
 
 		 447 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  36.36 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  36.36 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  39.33 
 
 		 447 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  34.51 
 
 		 454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  36.97 
 
 		 469 aa  269  7e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  39.16 
 
 		 475 aa  268  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  36.96 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  34.97 
 
 		 457 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  36.19 
 
 		 454 aa  266  7e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  37.98 
 
 		 443 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  35.43 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  35.43 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  35.09 
 
 		 456 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  38.84 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  38.84 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  39.02 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  39.02 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  38.84 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  39.06 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  38.84 
 
 		 452 aa  261  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  34.73 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  34.79 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  36.1 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  35.36 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  37.53 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>