245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2848 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
461 aa  885    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  65.28 
 
 
453 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  56.29 
 
 
452 aa  481  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  57.11 
 
 
452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  51.94 
 
 
470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  49.23 
 
 
457 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  50.88 
 
 
464 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  49.24 
 
 
466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  46.64 
 
 
464 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  46.44 
 
 
452 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  49.78 
 
 
452 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  46.1 
 
 
446 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  45.11 
 
 
461 aa  392  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  43.67 
 
 
453 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  42.79 
 
 
450 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  44.64 
 
 
486 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  48.7 
 
 
455 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  42.79 
 
 
450 aa  378  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  44.84 
 
 
486 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  44.07 
 
 
451 aa  359  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  46.82 
 
 
467 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  42.95 
 
 
467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  43.59 
 
 
478 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  41.83 
 
 
453 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  43.25 
 
 
454 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  40.95 
 
 
452 aa  346  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  44.03 
 
 
457 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  42.44 
 
 
450 aa  334  2e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  44.28 
 
 
459 aa  332  8e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  43.38 
 
 
467 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  43.59 
 
 
468 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  42.22 
 
 
449 aa  330  3e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  40.43 
 
 
476 aa  326  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  44.03 
 
 
449 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  41.29 
 
 
446 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  36.2 
 
 
446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  40.48 
 
 
463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  35.98 
 
 
446 aa  310  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  36.42 
 
 
446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  35.98 
 
 
446 aa  309  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  35.98 
 
 
446 aa  309  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.2 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  35.98 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  40 
 
 
456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.76 
 
 
446 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.98 
 
 
446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  36.2 
 
 
446 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  40.43 
 
 
452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  35.54 
 
 
446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  38.12 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  43.05 
 
 
453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  41.46 
 
 
463 aa  300  5e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  40.72 
 
 
450 aa  296  5e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  36.7 
 
 
455 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  40.18 
 
 
443 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  43.33 
 
 
448 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  38.62 
 
 
455 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  35.99 
 
 
453 aa  280  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  40.44 
 
 
475 aa  277  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  36.78 
 
 
484 aa  276  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  36.47 
 
 
468 aa  273  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  36.79 
 
 
470 aa  273  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  37.37 
 
 
465 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  35.63 
 
 
454 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  36.65 
 
 
483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  35.11 
 
 
444 aa  266  5e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  32.47 
 
 
456 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  36.62 
 
 
459 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  39.18 
 
 
455 aa  259  8e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  37.85 
 
 
468 aa  259  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  37.36 
 
 
451 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  37.09 
 
 
445 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  37.36 
 
 
452 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  37.09 
 
 
445 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  37.53 
 
 
445 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  37.14 
 
 
452 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  37.14 
 
 
452 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  37.36 
 
 
452 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  37.14 
 
 
451 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  36.87 
 
 
445 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  37.42 
 
 
486 aa  256  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  37.14 
 
 
452 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  35.18 
 
 
444 aa  256  7e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  36.87 
 
 
445 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  38.84 
 
 
461 aa  256  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  36.87 
 
 
445 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  34.3 
 
 
444 aa  255  9e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  36.67 
 
 
445 aa  256  9e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  36.64 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  36.87 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  34.96 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.09 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  35.17 
 
 
462 aa  254  3e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  32.44 
 
 
447 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  38.94 
 
 
451 aa  253  6e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  34.44 
 
 
450 aa  253  7e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 
446 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 
446 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  36.7 
 
 
447 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  35.78 
 
 
469 aa  249  5e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>