245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4776 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 459 aa  877    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  40.49 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  40.85 
 
 		 452 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  39.78 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  40 
 
 		 464 aa  306  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  39.05 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  40.44 
 
 		 464 aa  292  8e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  37.3 
 
 		 452 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  36.48 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  37.76 
 
 		 457 aa  286  5.999999999999999e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  39.28 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  39.64 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  36.43 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  35.96 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  36.56 
 
 		 446 aa  280  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  36.56 
 
 		 446 aa  279  9e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  36.56 
 
 		 446 aa  279  9e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  40.32 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  35.48 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.12 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  36.34 
 
 		 446 aa  276  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  39.29 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  35.9 
 
 		 446 aa  276  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  35.68 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  35.9 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.46 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.9 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  37.5 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  36.04 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  35.24 
 
 		 446 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  35.08 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  36.11 
 
 		 466 aa  266  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  38.04 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  35.03 
 
 		 486 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  37.5 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  37.5 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  37.55 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.5 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  37.28 
 
 		 445 aa  259  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  37.28 
 
 		 445 aa  259  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.5 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  37.28 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  37.28 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  38.14 
 
 		 453 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  37.12 
 
 		 447 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  36.56 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  37.33 
 
 		 453 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  38.43 
 
 		 459 aa  249  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  31.29 
 
 		 454 aa  247  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  35.99 
 
 		 450 aa  246  9e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.54 
 
 		 449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  36.22 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  36.62 
 
 		 461 aa  243  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  38.7 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  33.93 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  37.5 
 
 		 463 aa  240  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  36.06 
 
 		 468 aa  239  9e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  34.8 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  34.58 
 
 		 452 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  37.95 
 
 		 475 aa  236  7e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  35.09 
 
 		 470 aa  236  7e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  34.8 
 
 		 451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  37.47 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  34.14 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  33.92 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  33.92 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  34.81 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  33.92 
 
 		 451 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  37.72 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  35.02 
 
 		 451 aa  231  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  35.24 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  35.24 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.04 
 
 		 458 aa  229  8e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.19 
 
 		 455 aa  229  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  31.47 
 
 		 455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  36.06 
 
 		 467 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  35.16 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  32.81 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  32.81 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  33.09 
 
 		 453 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 449 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  30.99 
 
 		 447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  32.63 
 
 		 461 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  29.28 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  32.39 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  30.6 
 
 		 454 aa  211  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  31.6 
 
 		 461 aa  210  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  28.22 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  30.02 
 
 		 457 aa  209  8e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  30.63 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  32.95 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  32.36 
 
 		 454 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  32.24 
 
 		 469 aa  206  9e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  32.17 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  32.39 
 
 		 476 aa  206  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  31.73 
 
 		 484 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  34.62 
 
 		 448 aa  203  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  30.85 
 
 		 483 aa  203  6e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  29.23 
 
 		 453 aa  203  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  31.71 
 
 		 445 aa  202  9e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>