245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1818 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  84.65 
 
 
457 aa  758    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  100 
 
 
458 aa  908    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  77.73 
 
 
458 aa  730    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  63.11 
 
 
454 aa  593  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  64.51 
 
 
454 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  60.13 
 
 
454 aa  530  1e-149  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  60.36 
 
 
447 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  60.36 
 
 
447 aa  522  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  60.14 
 
 
447 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  38.39 
 
 
453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.98 
 
 
446 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.38 
 
 
453 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34 
 
 
452 aa  286  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  35.54 
 
 
446 aa  286  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.32 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  35.54 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  35.54 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  35.76 
 
 
446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  35.54 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  35.54 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  35.03 
 
 
446 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  35.32 
 
 
446 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  35.32 
 
 
446 aa  282  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.15 
 
 
476 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  35.29 
 
 
446 aa  276  8e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  35.29 
 
 
446 aa  276  8e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  34.38 
 
 
454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  36.63 
 
 
452 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  37.11 
 
 
475 aa  266  8e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  34 
 
 
450 aa  265  8.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  34.67 
 
 
450 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  35.68 
 
 
455 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 
470 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  32.67 
 
 
486 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.68 
 
 
455 aa  262  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.84 
 
 
456 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  33.84 
 
 
453 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  34.81 
 
 
453 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  33.55 
 
 
443 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  35.31 
 
 
459 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  37.17 
 
 
449 aa  257  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  33.71 
 
 
464 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  36.87 
 
 
452 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  36.87 
 
 
451 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  36.87 
 
 
452 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  36.87 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  36.87 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  32.52 
 
 
452 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.13 
 
 
468 aa  253  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.8 
 
 
486 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  31.54 
 
 
452 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  36.64 
 
 
451 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  34.97 
 
 
466 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  36.73 
 
 
452 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  32.45 
 
 
446 aa  250  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  35.86 
 
 
445 aa  249  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  31.57 
 
 
457 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  35.68 
 
 
447 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  35.18 
 
 
445 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  35.18 
 
 
445 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  35.18 
 
 
445 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  35.4 
 
 
445 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  35.51 
 
 
443 aa  246  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  35.4 
 
 
445 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  35.4 
 
 
445 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  35.28 
 
 
451 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 
451 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  34.96 
 
 
456 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.13 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  35.18 
 
 
445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  36.64 
 
 
452 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.43 
 
 
450 aa  241  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  32.82 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  36.2 
 
 
452 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  36.18 
 
 
452 aa  240  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  35.27 
 
 
445 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  32.82 
 
 
447 aa  238  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  35.21 
 
 
465 aa  239  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  35.02 
 
 
447 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  33.41 
 
 
453 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 
452 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  33.4 
 
 
461 aa  236  8e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  33.79 
 
 
454 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  31.59 
 
 
461 aa  233  6e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  32.2 
 
 
469 aa  232  9e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  31.65 
 
 
461 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  35.23 
 
 
470 aa  230  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  31 
 
 
457 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  32.03 
 
 
455 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  30.57 
 
 
468 aa  226  7e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 
431 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  34.46 
 
 
460 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0801  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
461 aa  223  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  31.99 
 
 
484 aa  223  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  32.29 
 
 
450 aa  222  9e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  34.3 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  32.29 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  31.99 
 
 
462 aa  220  5e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
460 aa  219  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  34.87 
 
 
451 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>