245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  100 
 
 		 461 aa  904    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  68.63 
 
 		 460 aa  607  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  67.11 
 
 		 458 aa  585  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  56.77 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  38.62 
 
 		 453 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  36.44 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.62 
 
 		 476 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.16 
 
 		 449 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.19 
 
 		 454 aa  250  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.38 
 
 		 452 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.28 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  35.73 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  34.04 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.19 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  34.77 
 
 		 473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  35.23 
 
 		 473 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  32.97 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  34.12 
 
 		 468 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  34.35 
 
 		 448 aa  237  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  32.6 
 
 		 470 aa  236  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  32.75 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.62 
 
 		 486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  33.78 
 
 		 431 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  35.33 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  32.45 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  30.46 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  34.66 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  32.4 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 		 446 aa  229  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  31.53 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  34.66 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  34.66 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  31.14 
 
 		 454 aa  229  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  31.53 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  34.66 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  34.88 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  31.31 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  34.22 
 
 		 446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  35.59 
 
 		 455 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  35.52 
 
 		 431 aa  226  9e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  34.44 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  33.77 
 
 		 502 aa  226  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  35.78 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  34.22 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  32.06 
 
 		 458 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  34.22 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  32.37 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  31 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  34.22 
 
 		 446 aa  224  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  31.52 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  33.19 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.13 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  35.16 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  36.12 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  34.63 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  32.47 
 
 		 494 aa  221  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  31.91 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  33.55 
 
 		 461 aa  220  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  34 
 
 		 446 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  34 
 
 		 446 aa  219  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  30.68 
 
 		 450 aa  219  7e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  33.62 
 
 		 447 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  32.82 
 
 		 452 aa  219  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  33.33 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  31.59 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  34.67 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  32.74 
 
 		 453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  33.92 
 
 		 452 aa  216  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  32.26 
 
 		 452 aa  216  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  34.51 
 
 		 443 aa  216  9e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  35.96 
 
 		 498 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  35.63 
 
 		 445 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  35.84 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  35.63 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  35.41 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  35.63 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  33.71 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  35.41 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  35.41 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  35.15 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  32 
 
 		 451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  30.47 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  32.68 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  35.19 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  35.41 
 
 		 445 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  33.62 
 
 		 450 aa  212  9e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  34.68 
 
 		 474 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  28.7 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  32.98 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  31.17 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  33.26 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  34.55 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  32.29 
 
 		 492 aa  210  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  32.36 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  31.81 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  32.4 
 
 		 454 aa  210  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  32.83 
 
 		 454 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  30.79 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>