245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1316 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
431 aa  825    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  39.63 
 
 
453 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  42.13 
 
 
455 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  37.41 
 
 
476 aa  259  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  41.16 
 
 
443 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  39.33 
 
 
452 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  39.19 
 
 
454 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  40.23 
 
 
449 aa  247  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  34.08 
 
 
454 aa  246  6.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  40.36 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  35.09 
 
 
446 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  38.17 
 
 
456 aa  244  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  35.84 
 
 
446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  34.62 
 
 
453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.76 
 
 
446 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.75 
 
 
453 aa  243  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  37.5 
 
 
446 aa  243  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  35.16 
 
 
446 aa  243  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  35.47 
 
 
446 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  35.39 
 
 
446 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.84 
 
 
446 aa  242  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  37.53 
 
 
454 aa  242  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  35.39 
 
 
446 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  38.28 
 
 
494 aa  242  1e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  34.84 
 
 
446 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  34.84 
 
 
446 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  33.49 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  42.61 
 
 
475 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  33.49 
 
 
447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  35.16 
 
 
446 aa  239  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  34.73 
 
 
502 aa  239  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  37.79 
 
 
452 aa  239  8e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  33.25 
 
 
447 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  33.63 
 
 
488 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.18 
 
 
454 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  35.52 
 
 
461 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  37.08 
 
 
458 aa  238  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  37.3 
 
 
470 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  36.72 
 
 
455 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  40.66 
 
 
503 aa  236  8e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  36.03 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  40.56 
 
 
503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  37.22 
 
 
527 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  32.97 
 
 
458 aa  233  6e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  40.11 
 
 
503 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  32.9 
 
 
457 aa  232  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  36.47 
 
 
492 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  36.71 
 
 
460 aa  230  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
493 aa  230  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  34.38 
 
 
450 aa  230  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  38.86 
 
 
453 aa  230  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  34.16 
 
 
450 aa  229  6e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  39.52 
 
 
452 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  37.91 
 
 
464 aa  229  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  33.81 
 
 
486 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  36.79 
 
 
459 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  40.89 
 
 
448 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  33.19 
 
 
458 aa  227  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2269  sodium:neurotransmitter symporter  37.41 
 
 
445 aa  227  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  33.57 
 
 
488 aa  227  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  35.1 
 
 
497 aa  226  8e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  36.95 
 
 
452 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  40.41 
 
 
442 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  33.76 
 
 
503 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  37.61 
 
 
453 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  36.06 
 
 
464 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  36.93 
 
 
453 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  34.35 
 
 
502 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  36.2 
 
 
461 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  34.62 
 
 
452 aa  223  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 
461 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  34.42 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  41.78 
 
 
451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.7 
 
 
486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  33.12 
 
 
498 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  37.65 
 
 
514 aa  219  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  36.54 
 
 
495 aa  219  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  33.41 
 
 
461 aa  219  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  35.37 
 
 
466 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.07 
 
 
445 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  35.51 
 
 
469 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  34.19 
 
 
499 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  32.79 
 
 
454 aa  217  4e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  35.81 
 
 
447 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  37.39 
 
 
437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  34.7 
 
 
486 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  40.82 
 
 
472 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 
456 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  36.84 
 
 
445 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  35.86 
 
 
451 aa  216  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  36.41 
 
 
502 aa  216  8e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  35.57 
 
 
462 aa  216  9e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  37.07 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  37.07 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  36.84 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  36.84 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  34.81 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  37.07 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  36.63 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  37.9 
 
 
547 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>