245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1637 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 451 aa  852    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  63.11 
 
 		 457 aa  543  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  58.88 
 
 		 446 aa  478  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  52.44 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  48.86 
 
 		 488 aa  350  3e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  41.48 
 
 		 454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  44.76 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  43.5 
 
 		 459 aa  303  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2007  sodium:neurotransmitter symporter  43.85 
 
 		 475 aa  302  9e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  39.2 
 
 		 452 aa  292  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3893  sodium:neurotransmitter symporter  46.59 
 
 		 488 aa  292  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  42.86 
 
 		 475 aa  292  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  43.75 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  40.54 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  41.24 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  40 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  40.92 
 
 		 468 aa  276  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  38.39 
 
 		 452 aa  275  9e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  38.31 
 
 		 457 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  39.38 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  36.32 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  39.12 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  43.56 
 
 		 448 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  37.76 
 
 		 453 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  42.12 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  38.94 
 
 		 461 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  36.47 
 
 		 446 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  39.08 
 
 		 455 aa  263  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  37.78 
 
 		 470 aa  262  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  37.26 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  40.64 
 
 		 450 aa  259  6e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  35.31 
 
 		 453 aa  259  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  39.02 
 
 		 464 aa  257  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  35.79 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  35.79 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  37 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  34.27 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  35.79 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  35.79 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.71 
 
 		 446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  35.35 
 
 		 446 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  35.57 
 
 		 446 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.71 
 
 		 446 aa  253  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  37.47 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  37.47 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  34.29 
 
 		 453 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  37.71 
 
 		 486 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  37.5 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  38.66 
 
 		 452 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  39.81 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  37.64 
 
 		 486 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  33.77 
 
 		 456 aa  246  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  39.52 
 
 		 453 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  35.7 
 
 		 464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  36.72 
 
 		 454 aa  242  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  33.26 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  34.47 
 
 		 470 aa  240  4e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  36.64 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  36.97 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  33.92 
 
 		 454 aa  239  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  35.53 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  34.64 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  41.37 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  36.54 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  37.18 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  35.9 
 
 		 466 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  36.49 
 
 		 449 aa  233  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  33.49 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  36.1 
 
 		 446 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.78 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  35.43 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  35.59 
 
 		 483 aa  230  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  32.79 
 
 		 455 aa  229  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  32.64 
 
 		 447 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  34.68 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  35.92 
 
 		 463 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  39.16 
 
 		 467 aa  227  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  36.72 
 
 		 478 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  34.87 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  32.41 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  36.18 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  32.41 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  36.47 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  33.98 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 484 aa  224  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  36.2 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  35.96 
 
 		 452 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  36.18 
 
 		 452 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  35.96 
 
 		 452 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  35.68 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  36.53 
 
 		 452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  33.57 
 
 		 462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  38.32 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  34.99 
 
 		 447 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  36.53 
 
 		 452 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  36.28 
 
 		 445 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  36.28 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  36.28 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  36.28 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  36.28 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>