245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0110 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
472 aa  884    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2007  sodium:neurotransmitter symporter  55.68 
 
 
475 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  51.09 
 
 
488 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3893  sodium:neurotransmitter symporter  54 
 
 
488 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  44.47 
 
 
443 aa  322  8e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  41.85 
 
 
457 aa  305  9.000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  43.67 
 
 
451 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  45.61 
 
 
446 aa  263  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  36.24 
 
 
459 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.07 
 
 
453 aa  229  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  32.67 
 
 
446 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  39.95 
 
 
454 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 
453 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.15 
 
 
452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  34.29 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  38.17 
 
 
468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  38.57 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  38.67 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  41.03 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  34.37 
 
 
446 aa  221  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  38.96 
 
 
448 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  33.8 
 
 
457 aa  220  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  32.96 
 
 
446 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  33.62 
 
 
452 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  32.82 
 
 
446 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  32.96 
 
 
446 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  32.38 
 
 
446 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  32.53 
 
 
446 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  38.29 
 
 
450 aa  218  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  33.11 
 
 
446 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  32.96 
 
 
446 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 
486 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  33.11 
 
 
446 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  37.11 
 
 
435 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  32.52 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  32.52 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  33.63 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  37.04 
 
 
455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  32.59 
 
 
470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 
461 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  37.7 
 
 
452 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  35.16 
 
 
443 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  44.76 
 
 
442 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  33.7 
 
 
457 aa  210  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  32.75 
 
 
461 aa  209  8e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  36.77 
 
 
446 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  32.96 
 
 
453 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  39.24 
 
 
451 aa  207  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  36.32 
 
 
453 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  37.15 
 
 
464 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  40.82 
 
 
431 aa  204  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  32.09 
 
 
466 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  32.73 
 
 
455 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  35.71 
 
 
452 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  39.71 
 
 
447 aa  203  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  36.65 
 
 
437 aa  203  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  38.48 
 
 
436 aa  202  9e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  34.53 
 
 
445 aa  202  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.36 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  36.17 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  34.53 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  39.36 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  34.53 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  38.53 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  33.56 
 
 
447 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  37.64 
 
 
476 aa  199  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  34.53 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  34.53 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  34.53 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  34.53 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  31.69 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  31.69 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  34.53 
 
 
445 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  34.15 
 
 
447 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  38.38 
 
 
454 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  34.28 
 
 
448 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  34.83 
 
 
441 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  38.46 
 
 
444 aa  194  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  34.13 
 
 
453 aa  195  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  34.45 
 
 
447 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  34.8 
 
 
451 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  35.24 
 
 
452 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  35.24 
 
 
452 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  32.34 
 
 
473 aa  193  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  33.19 
 
 
461 aa  193  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  33.95 
 
 
431 aa  193  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  34.31 
 
 
445 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  34.58 
 
 
452 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  30.74 
 
 
465 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  34.58 
 
 
452 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  34.09 
 
 
447 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  34.6 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  32.96 
 
 
470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  33.17 
 
 
450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  35.8 
 
 
467 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  34.09 
 
 
447 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  34.6 
 
 
451 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  35.27 
 
 
451 aa  189  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  34.45 
 
 
473 aa  189  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>