245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0250 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  100 
 
 		 441 aa  871    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  46.1 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  50.79 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  50.23 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  46.88 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0645  sodium-dependent tyrosine transporter  48.81 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  47.03 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1706  sodium/neurotransmitter symporter family protein  46.9 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  44.11 
 
 		 435 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  42.96 
 
 		 436 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  43.66 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1245  sodium:neurotransmitter symporter  41.2 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000515099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1246  sodium:neurotransmitter symporter  39.07 
 
 		 430 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000125308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  38.22 
 
 		 453 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  32.68 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  33.56 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  34.45 
 
 		 453 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  38.11 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  32.57 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  35.89 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  37.31 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.88 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  34.35 
 
 		 455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.81 
 
 		 453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  33.17 
 
 		 483 aa  213  7e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  34.79 
 
 		 465 aa  211  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  36.05 
 
 		 455 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  37 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  37.36 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  33.72 
 
 		 470 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  36.93 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  37.84 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  33.81 
 
 		 450 aa  202  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  41.19 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  33.89 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  33.81 
 
 		 450 aa  199  6e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  35.81 
 
 		 446 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  35.17 
 
 		 464 aa  199  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  31.89 
 
 		 486 aa  199  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  30.52 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  33.57 
 
 		 470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  32.14 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.81 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  35.92 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  33.56 
 
 		 502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  36.34 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  32.01 
 
 		 461 aa  196  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  33.81 
 
 		 466 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  34.48 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  34.24 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  34.83 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  30.66 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.11 
 
 		 458 aa  195  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  35.34 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  33.99 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  34.24 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.28 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  32.35 
 
 		 450 aa  193  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  37.35 
 
 		 456 aa  194  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  34.24 
 
 		 446 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  35.57 
 
 		 459 aa  192  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  33.99 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  33.99 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  29.07 
 
 		 456 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  34.28 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  34.62 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  30.66 
 
 		 454 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  34.07 
 
 		 447 aa  189  7e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  34.12 
 
 		 468 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  33.42 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  36.07 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  37.64 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  31.38 
 
 		 492 aa  187  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  34.71 
 
 		 463 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  32.8 
 
 		 527 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  31.39 
 
 		 461 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  36.11 
 
 		 473 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  30.24 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  30.24 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  32.8 
 
 		 499 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  34.72 
 
 		 461 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  29.31 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  30.29 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  29.31 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  29.48 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  32.31 
 
 		 450 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  32.27 
 
 		 495 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  34.78 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  33.05 
 
 		 458 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  33.07 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  32.45 
 
 		 449 aa  179  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  30.6 
 
 		 454 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  29.08 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2007  sodium:neurotransmitter symporter  35.57 
 
 		 475 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  32 
 
 		 486 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  34.05 
 
 		 498 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 		 445 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  32.06 
 
 		 454 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0404  sodium:neurotransmitter symporter  32.33 
 
 		 463 aa  176  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.630301  normal  0.211646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>