245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1706 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  76.71 
 
 
438 aa  678    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0645  sodium-dependent tyrosine transporter  82.38 
 
 
437 aa  721    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1706  sodium/neurotransmitter symporter family protein  100 
 
 
437 aa  867    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1245  sodium:neurotransmitter symporter  57.01 
 
 
434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000515099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1246  sodium:neurotransmitter symporter  52.68 
 
 
430 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000125308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  48.27 
 
 
448 aa  397  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  46.9 
 
 
441 aa  372  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  40 
 
 
437 aa  309  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  40.23 
 
 
447 aa  292  8e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  38.07 
 
 
435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  39.01 
 
 
464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  35.4 
 
 
436 aa  276  7e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  37.64 
 
 
437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  34.66 
 
 
453 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  36.07 
 
 
450 aa  203  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  32.15 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.63 
 
 
450 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  31.78 
 
 
476 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  32.34 
 
 
454 aa  193  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  31.29 
 
 
454 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  32.65 
 
 
452 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  32.8 
 
 
456 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.63 
 
 
453 aa  188  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  38.36 
 
 
473 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  29.35 
 
 
446 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  37.22 
 
 
475 aa  186  9e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  30.88 
 
 
470 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  30.39 
 
 
452 aa  183  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  32.1 
 
 
448 aa  183  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  31.72 
 
 
468 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  31.14 
 
 
451 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  30.16 
 
 
457 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  30.16 
 
 
486 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  31.61 
 
 
484 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  30.58 
 
 
448 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  29.36 
 
 
465 aa  176  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.54 
 
 
452 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  32.1 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  35.6 
 
 
473 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  26.67 
 
 
454 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  36.16 
 
 
455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  35.01 
 
 
470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  31.35 
 
 
446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  31.87 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  32.18 
 
 
455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  27.73 
 
 
468 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  31.58 
 
 
446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  30.93 
 
 
469 aa  172  7.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  31.58 
 
 
446 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  30.07 
 
 
454 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  31.58 
 
 
446 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  35.08 
 
 
452 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  31.58 
 
 
446 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  30.84 
 
 
446 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  30.84 
 
 
446 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  31.06 
 
 
459 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  30.91 
 
 
446 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  34.64 
 
 
452 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  30.62 
 
 
446 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  30.62 
 
 
446 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  30.3 
 
 
454 aa  169  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  30.29 
 
 
464 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  29.2 
 
 
447 aa  168  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  26.37 
 
 
458 aa  168  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  32.85 
 
 
453 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  29.2 
 
 
447 aa  168  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  33.15 
 
 
443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  28.84 
 
 
461 aa  166  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  29.72 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  30.86 
 
 
452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  30.75 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  28.97 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  33.9 
 
 
458 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  31.74 
 
 
502 aa  163  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  31.04 
 
 
455 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  30.68 
 
 
483 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  31.63 
 
 
470 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  29.37 
 
 
502 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  33.1 
 
 
431 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  30.57 
 
 
445 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  28.81 
 
 
486 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2007  sodium:neurotransmitter symporter  33.6 
 
 
475 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  30.55 
 
 
451 aa  160  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  30.84 
 
 
454 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  32.77 
 
 
474 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  34.58 
 
 
460 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  32.72 
 
 
457 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  31.21 
 
 
445 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  30.46 
 
 
464 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  29.36 
 
 
457 aa  158  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  31.21 
 
 
445 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  29.69 
 
 
497 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  30.26 
 
 
447 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0722  sodium:neurotransmitter symporter  33.61 
 
 
492 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000150418  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  31.29 
 
 
503 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  31.21 
 
 
445 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  31.91 
 
 
494 aa  158  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  30.99 
 
 
445 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  30.2 
 
 
450 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  30.99 
 
 
445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>