245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002721 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  100 
 
 		 454 aa  910    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  96.92 
 
 		 454 aa  866    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  83.33 
 
 		 454 aa  760    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  86.41 
 
 		 451 aa  768    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  55.65 
 
 		 448 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  52.13 
 
 		 448 aa  480  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  50.57 
 
 		 452 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  49.66 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  49.44 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  49.44 
 
 		 452 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  48.63 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  48.53 
 
 		 448 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  47.58 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0460  sodium:neurotransmitter symporter  49.07 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  44.74 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  44.74 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  44.74 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  44.3 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  44.52 
 
 		 454 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  44.82 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  37.06 
 
 		 473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  34.91 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.32 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.36 
 
 		 453 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  40.39 
 
 		 475 aa  243  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  36.65 
 
 		 468 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  35.33 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  34.49 
 
 		 476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  35.16 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  35.5 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  34.99 
 
 		 443 aa  232  9e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  36.36 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  36.13 
 
 		 454 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.9 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  34.4 
 
 		 470 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  34.85 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  32.32 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  34.62 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  34.84 
 
 		 446 aa  223  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  33.98 
 
 		 446 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  33.98 
 
 		 446 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  35.79 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  33.84 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.69 
 
 		 458 aa  220  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  34.13 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  33.98 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  33.98 
 
 		 446 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  34.19 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  33.41 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  36.34 
 
 		 456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  36.4 
 
 		 452 aa  216  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  33.12 
 
 		 450 aa  216  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.72 
 
 		 449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  32.55 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 453 aa  209  9e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  33.89 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.09 
 
 		 486 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  37.04 
 
 		 453 aa  207  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.55 
 
 		 455 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  30.53 
 
 		 447 aa  206  8e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  30.53 
 
 		 447 aa  206  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  35.42 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  31.18 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  32.2 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  30.85 
 
 		 454 aa  205  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  35.43 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  31.4 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  30.09 
 
 		 447 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  30.69 
 
 		 454 aa  202  7e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  33.97 
 
 		 457 aa  202  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  36.19 
 
 		 447 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  31.61 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  35.94 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  32.18 
 
 		 437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  32.35 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  32.26 
 
 		 458 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  31.28 
 
 		 451 aa  196  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  34.7 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  31.4 
 
 		 460 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  34.91 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  33.79 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  34.91 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  32.96 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  32.52 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  31.86 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  32.08 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  34.7 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  34.27 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  34.27 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  34.27 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  34.12 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  32.84 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  34.7 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  32.06 
 
 		 441 aa  192  8e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  30.7 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  34.76 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  31.63 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>