245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3587 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  100 
 
 		 445 aa  881    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  47.1 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  48.65 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  48.1 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  47.34 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  45.33 
 
 		 452 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  44.9 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  46.85 
 
 		 448 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  45.64 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  44.52 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  45.5 
 
 		 448 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0460  sodium:neurotransmitter symporter  47.34 
 
 		 436 aa  362  8e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  44.94 
 
 		 451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  44.99 
 
 		 454 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  44.89 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  45.43 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  44.89 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  43.6 
 
 		 454 aa  353  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  45.54 
 
 		 454 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  44.82 
 
 		 454 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.75 
 
 		 455 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  39.24 
 
 		 453 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 		 473 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  33.7 
 
 		 476 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  32.7 
 
 		 473 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  33.55 
 
 		 474 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.88 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  35.04 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 453 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.77 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  34.04 
 
 		 475 aa  211  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.47 
 
 		 458 aa  209  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  34.76 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  34.85 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  32.47 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  32.98 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 446 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  33.41 
 
 		 453 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.89 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  32.9 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  32.32 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  31.7 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  34.78 
 
 		 452 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  32.46 
 
 		 443 aa  203  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  34.5 
 
 		 451 aa  203  6e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.18 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.67 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  31.73 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  39.5 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  31.04 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  32.03 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  32.03 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  32.23 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  32.09 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  33.56 
 
 		 454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  32.23 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  31.84 
 
 		 458 aa  200  5e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  31.07 
 
 		 446 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  34.14 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  31.81 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  32.02 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  31.29 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  29.21 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  31.6 
 
 		 456 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  33.98 
 
 		 466 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  36.29 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  34.12 
 
 		 455 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  33.12 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.99 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  33.19 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  33.62 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  32.3 
 
 		 452 aa  193  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  31.77 
 
 		 464 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  31.25 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  32.7 
 
 		 467 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  34.49 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  32.47 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  34.42 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  32.73 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  34.64 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  29.4 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  34.64 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  28.63 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  34.42 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  32.39 
 
 		 454 aa  190  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  34.42 
 
 		 445 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  34.42 
 
 		 445 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  34.42 
 
 		 445 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  34.42 
 
 		 445 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  35.35 
 
 		 472 aa  189  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  31.94 
 
 		 465 aa  189  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  32.88 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.25 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  31.75 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  33.62 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  29.1 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  30.23 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  30.23 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  33.56 
 
 		 483 aa  186  6e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>