244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0460 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0460  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 436 aa  866    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  86.01 
 
 		 452 aa  753    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  78.01 
 
 		 452 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  81.15 
 
 		 458 aa  707    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  66.82 
 
 		 454 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  66.59 
 
 		 454 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  66.59 
 
 		 454 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  66.59 
 
 		 454 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  66.36 
 
 		 454 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  52.68 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  50.47 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  48.93 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  49.88 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  48.02 
 
 		 431 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  48.45 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  47.97 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  45.81 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  47.82 
 
 		 448 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  48.95 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  46.92 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  35 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  32.45 
 
 		 473 aa  226  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  36.24 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.35 
 
 		 476 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.03 
 
 		 453 aa  223  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  33.78 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  32.46 
 
 		 473 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  32 
 
 		 486 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.89 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  32.02 
 
 		 474 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.63 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  34.74 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  33.78 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  34.08 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  33.11 
 
 		 446 aa  203  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  35.04 
 
 		 453 aa  202  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  31.78 
 
 		 452 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.18 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  29.54 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  32.24 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  30.49 
 
 		 450 aa  200  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  33.02 
 
 		 461 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  34.23 
 
 		 455 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  32.37 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  33.04 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  32.44 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  32.6 
 
 		 470 aa  196  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  31.32 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  31.65 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  30.24 
 
 		 459 aa  192  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 455 aa  192  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  32.21 
 
 		 449 aa  192  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  30.99 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  30.99 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  32.37 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  30.55 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  31.66 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  30.07 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  32.51 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  32.6 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  31.3 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  29.25 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  29.48 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  29.48 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  30.22 
 
 		 453 aa  183  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  31.47 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  30.6 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  29.48 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  29.48 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1292  sodium- and chloride-dependent transporter  31.4 
 
 		 458 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.889918  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  30.2 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  29.98 
 
 		 449 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  28.76 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  29.48 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  29.17 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  29.04 
 
 		 446 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  29.26 
 
 		 446 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  29.04 
 
 		 446 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  29.82 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  30.2 
 
 		 457 aa  176  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  29.04 
 
 		 446 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  29.04 
 
 		 446 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  30.13 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  28.42 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  30.8 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  30.63 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  29.26 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  29.82 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  30.24 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  30.66 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  36.16 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  31.82 
 
 		 451 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  30.84 
 
 		 456 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  30.04 
 
 		 454 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  28.82 
 
 		 446 aa  173  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  29 
 
 		 437 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  30.53 
 
 		 448 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  32.6 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  30.32 
 
 		 438 aa  172  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>