245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1292 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1292  sodium- and chloride-dependent transporter  100 
 
 
458 aa  892    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.889918  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  67.84 
 
 
448 aa  595  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  65.86 
 
 
448 aa  579  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  60.26 
 
 
445 aa  520  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  56.19 
 
 
444 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  57.02 
 
 
444 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  56.79 
 
 
444 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  56.57 
 
 
444 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1200  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  58.3 
 
 
450 aa  456  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.332542  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  51.23 
 
 
447 aa  442  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1198  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  53.41 
 
 
444 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  49.23 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0530  sodium- and chloride-dependent transporter  51.13 
 
 
445 aa  412  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0959  ModE family transcriptional regulator  46.21 
 
 
443 aa  381  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.167837  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1012  sodium transporter, putative  47.02 
 
 
446 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0941  sodium transporter, putative  47.24 
 
 
446 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1504  sodium/neurotransmitter symporter family protein  45.7 
 
 
443 aa  375  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0880  putative sodium transporter  47.02 
 
 
446 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0426981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  36.1 
 
 
453 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  36.22 
 
 
486 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  36.64 
 
 
461 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  35.68 
 
 
470 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  35.23 
 
 
454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  34.72 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 
452 aa  232  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  34.73 
 
 
464 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  38.12 
 
 
445 aa  229  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 
486 aa  226  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  34.23 
 
 
457 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.57 
 
 
453 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  34.73 
 
 
464 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.14 
 
 
445 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  36.2 
 
 
455 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  35.49 
 
 
446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.49 
 
 
446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  37.84 
 
 
443 aa  223  8e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  36.91 
 
 
445 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  36.97 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  34.82 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  35.04 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  35.04 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  35.04 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  36.91 
 
 
445 aa  221  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  36.91 
 
 
445 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.57 
 
 
455 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  36.91 
 
 
445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  34.91 
 
 
476 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  36.91 
 
 
445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  33.12 
 
 
452 aa  220  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  36.69 
 
 
445 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  36.75 
 
 
447 aa  219  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.04 
 
 
446 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  35.04 
 
 
446 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  32.37 
 
 
446 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  34.82 
 
 
446 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  34.82 
 
 
446 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  35.02 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  34.3 
 
 
446 aa  216  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.24 
 
 
452 aa  216  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  34.79 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  34.47 
 
 
456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  36.81 
 
 
447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  34.87 
 
 
450 aa  212  9e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  34.6 
 
 
451 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  33.41 
 
 
457 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  34.43 
 
 
450 aa  211  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.67 
 
 
468 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  33.56 
 
 
453 aa  210  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  34.42 
 
 
467 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  32.52 
 
 
459 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  32.4 
 
 
461 aa  208  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  32.59 
 
 
450 aa  206  7e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  33.69 
 
 
478 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  32.01 
 
 
449 aa  203  6e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  32.63 
 
 
448 aa  202  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  34.81 
 
 
466 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  31.77 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  32.75 
 
 
431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  31.81 
 
 
459 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  33.91 
 
 
467 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  32.96 
 
 
461 aa  193  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  31.74 
 
 
448 aa  192  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  31 
 
 
449 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  31.62 
 
 
458 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  35.36 
 
 
475 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  34 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  34.47 
 
 
454 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  28.94 
 
 
454 aa  189  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  30.35 
 
 
448 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  37.06 
 
 
451 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  36.84 
 
 
452 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  37.77 
 
 
451 aa  187  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  31.57 
 
 
449 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  32.39 
 
 
446 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  32.07 
 
 
461 aa  187  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  31.21 
 
 
452 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.58 
 
 
453 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  36.84 
 
 
452 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  36.62 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>