245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4406 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  100 
 
 		 474 aa  931    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  67.02 
 
 		 473 aa  624  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  64.9 
 
 		 473 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  41.01 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  36.71 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  37.74 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  38.3 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  37.61 
 
 		 455 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.06 
 
 		 452 aa  256  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  36.73 
 
 		 446 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.73 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  36.67 
 
 		 446 aa  251  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  36.63 
 
 		 446 aa  250  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  36.11 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  36.31 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  36.13 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  36.31 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  36.09 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  36.64 
 
 		 446 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.68 
 
 		 446 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.68 
 
 		 446 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  37.21 
 
 		 448 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  39.29 
 
 		 456 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.23 
 
 		 449 aa  240  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  36.29 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  34.89 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  38.81 
 
 		 475 aa  233  6e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  35.41 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  34.75 
 
 		 461 aa  231  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  39.84 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  34.98 
 
 		 454 aa  230  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  36.98 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  35.97 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  35.16 
 
 		 454 aa  226  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  34.28 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  34.04 
 
 		 486 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  33.9 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  34.78 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.02 
 
 		 468 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  34.38 
 
 		 448 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 454 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  35.68 
 
 		 456 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  34.97 
 
 		 470 aa  223  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  32.64 
 
 		 483 aa  223  9e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  32.98 
 
 		 458 aa  220  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  35.27 
 
 		 455 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  34.3 
 
 		 449 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.93 
 
 		 455 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  32.85 
 
 		 450 aa  219  7e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  34.8 
 
 		 431 aa  219  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  33.56 
 
 		 450 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  34.92 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  35.29 
 
 		 465 aa  216  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.68 
 
 		 453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  33.98 
 
 		 447 aa  216  9e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  34.83 
 
 		 452 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  34.18 
 
 		 486 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  30.56 
 
 		 461 aa  213  7e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  34.18 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  34.96 
 
 		 448 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  32.12 
 
 		 446 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  36.09 
 
 		 460 aa  210  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  35.47 
 
 		 445 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  33.76 
 
 		 445 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  35.47 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  35.47 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  35.47 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  35.39 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  34.97 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  35.39 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  35.11 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  33.82 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  32.01 
 
 		 469 aa  208  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  35.47 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  34.93 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  35 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  35.17 
 
 		 454 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  35.17 
 
 		 454 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  34.17 
 
 		 460 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  38.08 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  38.29 
 
 		 447 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  35.17 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  38.29 
 
 		 447 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  32.49 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  34.63 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  34.78 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  32.13 
 
 		 488 aa  202  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.68 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  31.51 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  31.92 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  33.19 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  30.08 
 
 		 484 aa  200  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  30.98 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  34.82 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  33.78 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  31.22 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  33.71 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 461 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  36.49 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>