245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4081 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  100 
 
 		 448 aa  894    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  57.88 
 
 		 449 aa  501  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  56.45 
 
 		 431 aa  497  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  56.18 
 
 		 448 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  53.08 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  54.16 
 
 		 448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  53.55 
 
 		 452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  52.66 
 
 		 452 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  53.27 
 
 		 448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  49.32 
 
 		 454 aa  438  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0460  sodium:neurotransmitter symporter  52.68 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  50.45 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  50.68 
 
 		 454 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  51.25 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  50.91 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  50.46 
 
 		 454 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  48.76 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  50.23 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  48.53 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  46.85 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  37.69 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.36 
 
 		 455 aa  250  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  39.43 
 
 		 475 aa  239  9e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.75 
 
 		 476 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  35.37 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  37.44 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  34.89 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.81 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  37.04 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.28 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.55 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  33.33 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  34.58 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  37.27 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  34.38 
 
 		 474 aa  222  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  34.28 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  32.03 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  36.74 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  35.12 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  35.87 
 
 		 453 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  32.33 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  32.24 
 
 		 447 aa  213  7.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  33.77 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  31.39 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  33.12 
 
 		 446 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  34.27 
 
 		 454 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  31.72 
 
 		 473 aa  209  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  33.12 
 
 		 446 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  34.85 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  32.54 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  32.42 
 
 		 473 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  32.9 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  34.63 
 
 		 464 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  32.9 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  32.9 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  32.62 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  32.41 
 
 		 454 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.43 
 
 		 486 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  36.19 
 
 		 446 aa  206  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  30.96 
 
 		 443 aa  206  9e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  32.75 
 
 		 452 aa  206  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  32.25 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  34.12 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  33.62 
 
 		 464 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1198  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  32.29 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  32.31 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  32.47 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  32.25 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  32.25 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  32.47 
 
 		 446 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  34.57 
 
 		 470 aa  203  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  34.14 
 
 		 458 aa  202  9e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  34.92 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  33.94 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  31.43 
 
 		 447 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  31.43 
 
 		 447 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  33.4 
 
 		 467 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  31.26 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  30.77 
 
 		 488 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  34.05 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  30.24 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  36.45 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0958  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.01 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  29.81 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  33.77 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  32.97 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  30.69 
 
 		 454 aa  193  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  32.62 
 
 		 461 aa  193  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  31.45 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  33.84 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  33.84 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  34.06 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  34.46 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  33.62 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  32.87 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.55 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  32.97 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  33.84 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>