245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2975 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
488 aa  935    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  51.09 
 
 
472 aa  405  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2007  sodium:neurotransmitter symporter  51.94 
 
 
475 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3893  sodium:neurotransmitter symporter  49.09 
 
 
488 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  47.7 
 
 
443 aa  342  7e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  46.38 
 
 
457 aa  332  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  47.5 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  46.51 
 
 
446 aa  324  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  37.16 
 
 
453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.84 
 
 
455 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  37.06 
 
 
453 aa  252  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  36.18 
 
 
443 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  35.81 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  35.9 
 
 
475 aa  242  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  38.84 
 
 
468 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  35.51 
 
 
446 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  35.38 
 
 
454 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  38.4 
 
 
449 aa  237  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  32.52 
 
 
446 aa  236  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  32.08 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  32.3 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  32.29 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  36.26 
 
 
452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  32.3 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  32.52 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  33.48 
 
 
476 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  35 
 
 
470 aa  233  8.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  32.08 
 
 
446 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  32.3 
 
 
446 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  32.3 
 
 
446 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 
452 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  31.86 
 
 
446 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  31.7 
 
 
446 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  35.28 
 
 
486 aa  230  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  38.15 
 
 
464 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  36.18 
 
 
483 aa  229  9e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  34.44 
 
 
450 aa  228  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  34.57 
 
 
470 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  34.22 
 
 
450 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  30.63 
 
 
453 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  39.91 
 
 
453 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 
455 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  32.89 
 
 
469 aa  224  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  30.72 
 
 
456 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  35.26 
 
 
464 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  34.93 
 
 
452 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  32.83 
 
 
455 aa  222  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.56 
 
 
456 aa  220  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  31.82 
 
 
454 aa  219  6e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  31.45 
 
 
453 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  37.43 
 
 
486 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  35.36 
 
 
460 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  34.46 
 
 
484 aa  216  7e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  30.47 
 
 
458 aa  216  8e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  36.43 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  35 
 
 
462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  35.58 
 
 
448 aa  214  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  31.1 
 
 
465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  36.74 
 
 
461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  36.28 
 
 
451 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  38.52 
 
 
452 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  35.81 
 
 
461 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  30.4 
 
 
454 aa  210  4e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 
468 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 
486 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  36.06 
 
 
452 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  38.44 
 
 
466 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  35.84 
 
 
452 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  36.41 
 
 
445 aa  209  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  36.86 
 
 
445 aa  209  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  36.86 
 
 
445 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.4 
 
 
445 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  35.84 
 
 
452 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  36.86 
 
 
445 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  37.12 
 
 
453 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  36.86 
 
 
445 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  36.06 
 
 
452 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  36.06 
 
 
451 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  36.06 
 
 
452 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  36.41 
 
 
445 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  36.41 
 
 
445 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0801  sodium:neurotransmitter symporter  36.29 
 
 
461 aa  206  9e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  31.81 
 
 
454 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  36.28 
 
 
452 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  35.84 
 
 
452 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  35.62 
 
 
451 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  35.98 
 
 
445 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  33.26 
 
 
452 aa  203  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  36.94 
 
 
444 aa  203  7e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  35.96 
 
 
447 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  32.08 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  35.82 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  30.79 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  36.66 
 
 
447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  31.76 
 
 
461 aa  200  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  34.11 
 
 
468 aa  199  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  32.57 
 
 
497 aa  199  7e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  34.29 
 
 
435 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  34.48 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0404  sodium:neurotransmitter symporter  35.36 
 
 
463 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.630301  normal  0.211646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>