245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4156 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 452 aa  905    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  78.71 
 
 		 458 aa  716    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0460  sodium:neurotransmitter symporter  86.01 
 
 		 436 aa  716    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  75.23 
 
 		 452 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  66.22 
 
 		 454 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  65.18 
 
 		 454 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  65.4 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  65.4 
 
 		 454 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  65.18 
 
 		 454 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  53.55 
 
 		 448 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  49.77 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  48.87 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  51.45 
 
 		 451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  49.44 
 
 		 454 aa  441  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  48.74 
 
 		 449 aa  444  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  47.98 
 
 		 454 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  49.66 
 
 		 454 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  49.89 
 
 		 448 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  47.21 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  45.64 
 
 		 445 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  36.19 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  36.17 
 
 		 453 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  32.55 
 
 		 473 aa  233  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  34.49 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.57 
 
 		 456 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  32.26 
 
 		 461 aa  229  9e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  34.84 
 
 		 454 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  36.13 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  33.85 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.97 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  34.78 
 
 		 474 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  34.91 
 
 		 464 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  35.39 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  30.75 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.5 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  30.82 
 
 		 450 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  33.83 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  33.91 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.03 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  34.56 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.44 
 
 		 449 aa  213  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  30.87 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  30.64 
 
 		 453 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  32.47 
 
 		 475 aa  209  8e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  32.95 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  33.62 
 
 		 455 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  31.97 
 
 		 453 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  32.91 
 
 		 460 aa  206  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  32.05 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  32.13 
 
 		 455 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  29.46 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  33.97 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  31.69 
 
 		 459 aa  203  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  31.97 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  32.18 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  31.97 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  32.76 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  31.75 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  30.34 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  30.34 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  30.97 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  30.97 
 
 		 447 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  30.64 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  30.34 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  31.03 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  32.05 
 
 		 455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  30.56 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  30.64 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  31.76 
 
 		 457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  30.26 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  30.13 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  31.78 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  30.13 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  30.56 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  31.67 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  30.43 
 
 		 446 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  30.64 
 
 		 446 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  31.52 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  31.39 
 
 		 458 aa  194  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  31.85 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1292  sodium- and chloride-dependent transporter  31.14 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.889918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  30.43 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  30.98 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  30.43 
 
 		 457 aa  189  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  29.93 
 
 		 454 aa  189  9e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  30.85 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  30.72 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  30.63 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  31.63 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  29.12 
 
 		 458 aa  186  8e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  29.08 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  32.52 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  30.87 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  29.61 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  35.81 
 
 		 431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  30.99 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  31.21 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>