245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2211 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 435 aa  856    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  67.98 
 
 		 436 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  67.52 
 
 		 437 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  51.76 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  44.11 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  40.14 
 
 		 448 aa  336  5e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  40.5 
 
 		 447 aa  313  3.9999999999999997e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  38.07 
 
 		 438 aa  300  2e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1706  sodium/neurotransmitter symporter family protein  38.07 
 
 		 437 aa  292  6e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  37.79 
 
 		 464 aa  289  6e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0645  sodium-dependent tyrosine transporter  37.56 
 
 		 437 aa  277  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.9 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1245  sodium:neurotransmitter symporter  36.18 
 
 		 434 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000515099  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  34.66 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  36.3 
 
 		 452 aa  239  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  38.41 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  38.1 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  38.1 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  38.1 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.67 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  36.68 
 
 		 446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  37.57 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  37.57 
 
 		 446 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  34.42 
 
 		 502 aa  233  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  38.1 
 
 		 446 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  37.57 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  34.15 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  37.8 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  37.3 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  37.3 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  37.3 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  36.14 
 
 		 454 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  34.66 
 
 		 455 aa  229  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  35.02 
 
 		 446 aa  229  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 499 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  40.77 
 
 		 475 aa  223  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  32.34 
 
 		 453 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  33.98 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  33.04 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  33.77 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  34.27 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  37.11 
 
 		 472 aa  220  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  33.56 
 
 		 470 aa  219  7.999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  37.93 
 
 		 456 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  32.54 
 
 		 495 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  34.81 
 
 		 527 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.87 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1246  sodium:neurotransmitter symporter  32.95 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  36.63 
 
 		 445 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  36.63 
 
 		 445 aa  212  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  31.22 
 
 		 469 aa  212  9e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  36.63 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  36.63 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  31.98 
 
 		 448 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  34.29 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  36.14 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  36.14 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  37.5 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  36.39 
 
 		 445 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  36.14 
 
 		 445 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  34.01 
 
 		 452 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  31.67 
 
 		 454 aa  209  8e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  32.59 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  37.11 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  35.98 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  30.95 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  37.11 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  31.91 
 
 		 486 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  37.14 
 
 		 452 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  32.37 
 
 		 486 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  36.89 
 
 		 452 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.37 
 
 		 455 aa  206  8e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  36.89 
 
 		 452 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  34.68 
 
 		 486 aa  206  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  36.73 
 
 		 447 aa  206  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  33.02 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  34.82 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  32.84 
 
 		 443 aa  205  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  29.74 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  35.96 
 
 		 447 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0801  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  37.05 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  36.83 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  31.84 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  31.84 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  34.29 
 
 		 488 aa  204  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  31.92 
 
 		 465 aa  203  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  34.72 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  34.83 
 
 		 464 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  34.57 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  31.82 
 
 		 458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  31.66 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  34.91 
 
 		 503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  32.04 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 492 aa  200  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  32.28 
 
 		 452 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  36.59 
 
 		 450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>