245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0368 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0645  sodium-dependent tyrosine transporter  77.01 
 
 
437 aa  666    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  100 
 
 
438 aa  873    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1706  sodium/neurotransmitter symporter family protein  76.71 
 
 
437 aa  678    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1245  sodium:neurotransmitter symporter  59.17 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000515099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1246  sodium:neurotransmitter symporter  54.42 
 
 
430 aa  436  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000125308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  48.03 
 
 
448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  46.88 
 
 
441 aa  382  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  41.44 
 
 
437 aa  322  7e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  41.63 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  40.32 
 
 
464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  38.07 
 
 
435 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  39.72 
 
 
437 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  36.34 
 
 
436 aa  280  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  33.63 
 
 
453 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  30.58 
 
 
450 aa  202  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  30.43 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  32.62 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  29.82 
 
 
446 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  32.95 
 
 
450 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  29.78 
 
 
453 aa  193  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  31.22 
 
 
452 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  30.84 
 
 
454 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  30.84 
 
 
465 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 
473 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  29.3 
 
 
458 aa  186  6e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  29.41 
 
 
470 aa  186  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  36.77 
 
 
473 aa  186  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  29.15 
 
 
476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  31.38 
 
 
468 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  31.15 
 
 
459 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  29.84 
 
 
456 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  32.84 
 
 
498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  37.05 
 
 
475 aa  180  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 
455 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  31.04 
 
 
446 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  31.09 
 
 
446 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  28.32 
 
 
454 aa  179  8e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  30.5 
 
 
446 aa  179  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  30.48 
 
 
446 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  30.5 
 
 
446 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  28.57 
 
 
457 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  28.8 
 
 
452 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  31.05 
 
 
497 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30 
 
 
452 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  30.67 
 
 
446 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  31.13 
 
 
446 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  31.65 
 
 
457 aa  176  6e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  30.79 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  30.07 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  32.43 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  30.07 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  30.11 
 
 
464 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  31.22 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  31.15 
 
 
446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  30.96 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  28.51 
 
 
484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  30.79 
 
 
486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  30.93 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  31.07 
 
 
502 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  29.49 
 
 
452 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  28.57 
 
 
469 aa  172  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  32.31 
 
 
445 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  32.31 
 
 
445 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  31.61 
 
 
553 aa  172  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  33.16 
 
 
470 aa  172  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  29.81 
 
 
447 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  29.58 
 
 
447 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.11 
 
 
486 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  29.81 
 
 
447 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  32.31 
 
 
445 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  32.1 
 
 
445 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  31 
 
 
448 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  31.95 
 
 
447 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  32.1 
 
 
445 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  32.1 
 
 
445 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  31.98 
 
 
453 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  32.1 
 
 
445 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  29.14 
 
 
456 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  32.1 
 
 
445 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  29.98 
 
 
453 aa  169  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  32.03 
 
 
447 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  29.76 
 
 
458 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  33.07 
 
 
508 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  29.71 
 
 
461 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  33.42 
 
 
508 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  33.42 
 
 
508 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  29.66 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  33.42 
 
 
508 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  32.42 
 
 
508 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  33.07 
 
 
508 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  33.42 
 
 
508 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  33.42 
 
 
508 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  33.94 
 
 
451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  32.69 
 
 
508 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  30.37 
 
 
454 aa  166  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  32.69 
 
 
508 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  29.81 
 
 
493 aa  166  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  30.18 
 
 
502 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>