245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1621 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  100 
 
 		 437 aa  849    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  54.69 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  51.74 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  48.97 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  45.72 
 
 		 448 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  44.62 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  38.83 
 
 		 447 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  39.26 
 
 		 438 aa  302  1e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0645  sodium-dependent tyrosine transporter  38.24 
 
 		 437 aa  296  4e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1706  sodium/neurotransmitter symporter family protein  37.84 
 
 		 437 aa  289  7e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  36.96 
 
 		 464 aa  286  5e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1245  sodium:neurotransmitter symporter  37.04 
 
 		 434 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000515099  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  32.24 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  32.73 
 
 		 484 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.61 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  35.08 
 
 		 450 aa  224  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  34 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  34 
 
 		 446 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  32.28 
 
 		 470 aa  222  8e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.08 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  33.49 
 
 		 483 aa  222  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  34.84 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  37.22 
 
 		 446 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.49 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  36.41 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  35.82 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  35.82 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  35.82 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  35.82 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  32.31 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1246  sodium:neurotransmitter symporter  32.56 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000125308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  35.82 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  35.25 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  36.16 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.91 
 
 		 446 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  31.3 
 
 		 468 aa  213  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  34.66 
 
 		 446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  38.52 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.02 
 
 		 453 aa  210  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  39.35 
 
 		 475 aa  210  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.24 
 
 		 455 aa  210  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.93 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0801  sodium:neurotransmitter symporter  35.78 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  35.03 
 
 		 453 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  32.65 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  31.81 
 
 		 455 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  31.32 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  32.23 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  34.26 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  31.8 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0092  sodium-dependent transporter, putative  34.51 
 
 		 442 aa  200  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  32.54 
 
 		 454 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  30.11 
 
 		 502 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.56 
 
 		 456 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  29.98 
 
 		 453 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  30.79 
 
 		 461 aa  196  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 456 aa  196  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  35.77 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  35.77 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  34.67 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  32.09 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  35.26 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  35.52 
 
 		 445 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  35.52 
 
 		 445 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  35.52 
 
 		 445 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  34.41 
 
 		 448 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  30.71 
 
 		 454 aa  192  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  35.26 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  30.92 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  34.96 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  32.23 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  31.38 
 
 		 465 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  32.63 
 
 		 470 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  32.09 
 
 		 454 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  31.81 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  31.74 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  29.82 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  34 
 
 		 518 aa  187  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0404  sodium:neurotransmitter symporter  31.64 
 
 		 463 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.630301  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  30.14 
 
 		 443 aa  186  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  35.16 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  31.86 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  33.73 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  34.68 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  35.19 
 
 		 447 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.19 
 
 		 447 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  30.05 
 
 		 488 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  29.54 
 
 		 493 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  33.41 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  33.41 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  33.41 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  32.26 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  33.63 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  33.63 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  31.62 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  34.43 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  33.63 
 
 		 451 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>