245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13520 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  100 
 
 		 464 aa  915    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  66.29 
 
 		 447 aa  567  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  50.79 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  39.73 
 
 		 448 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  40.32 
 
 		 437 aa  315  9e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  40.32 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  39.73 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0645  sodium-dependent tyrosine transporter  39.72 
 
 		 437 aa  298  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1706  sodium/neurotransmitter symporter family protein  39.01 
 
 		 437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  37.79 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  36.51 
 
 		 437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1245  sodium:neurotransmitter symporter  37.24 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000515099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1246  sodium:neurotransmitter symporter  34.11 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000125308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  38.53 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.57 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  34.23 
 
 		 455 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.49 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 		 453 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  35.37 
 
 		 473 aa  192  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  34.09 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  34.17 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  34 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  31.21 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  32.67 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  34.78 
 
 		 459 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  32.31 
 
 		 486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  32.9 
 
 		 488 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.19 
 
 		 452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  32.89 
 
 		 461 aa  182  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  32.8 
 
 		 448 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 449 aa  179  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  34.12 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2007  sodium:neurotransmitter symporter  34.34 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  32.91 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  33.69 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  32.43 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  34.12 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  34.86 
 
 		 473 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  32.06 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  33.7 
 
 		 502 aa  176  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  31.63 
 
 		 465 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  31.84 
 
 		 488 aa  176  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  33.02 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.56 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  33.63 
 
 		 476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  31.67 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  35.71 
 
 		 553 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  32.68 
 
 		 451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  32.23 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  31.35 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 		 460 aa  169  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  30.63 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  31.86 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  29.37 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  31.21 
 
 		 470 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  30.72 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  29.91 
 
 		 450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  31.15 
 
 		 456 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  32.81 
 
 		 461 aa  166  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  31.81 
 
 		 508 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  34.65 
 
 		 456 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  31.8 
 
 		 486 aa  166  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  35.67 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3893  sodium:neurotransmitter symporter  32.71 
 
 		 488 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  31.02 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  31.3 
 
 		 483 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  32.46 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  31.02 
 
 		 508 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  31.02 
 
 		 508 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  31.02 
 
 		 508 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  31.02 
 
 		 508 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  31.02 
 
 		 508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  31.02 
 
 		 508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  28.63 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  31.78 
 
 		 468 aa  163  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  31.5 
 
 		 431 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  32.86 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  36.24 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  30.75 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  30.75 
 
 		 508 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  32 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  31.98 
 
 		 452 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  32 
 
 		 454 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  31.36 
 
 		 448 aa  161  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  32 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  30.56 
 
 		 508 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  28.1 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  32.27 
 
 		 506 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  36.22 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  35.56 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  32.26 
 
 		 464 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  34.49 
 
 		 452 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  29.79 
 
 		 502 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  29.85 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  30.36 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  32 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  33.43 
 
 		 446 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  31.73 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  29.79 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>