245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1598 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  87.24 
 
 		 486 aa  853    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  70.14 
 
 		 499 aa  700    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  72.41 
 
 		 495 aa  719    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  86.6 
 
 		 488 aa  850    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  77.62 
 
 		 488 aa  775    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  72.41 
 
 		 498 aa  708    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  67.21 
 
 		 503 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  100 
 
 		 527 aa  1057    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  56.2 
 
 		 492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  55.01 
 
 		 498 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  51.64 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  49.07 
 
 		 506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  46.15 
 
 		 508 aa  448  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  47.43 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  44.06 
 
 		 502 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  46.15 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  46.15 
 
 		 508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  48.47 
 
 		 497 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  46.15 
 
 		 508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  46.15 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  46.04 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  45.95 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  45.95 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  45.62 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  45.83 
 
 		 508 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  44.81 
 
 		 508 aa  435  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  46.29 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  45.63 
 
 		 503 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  45.85 
 
 		 503 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  45.1 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  45.29 
 
 		 510 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  43.27 
 
 		 505 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  43.27 
 
 		 517 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  42.86 
 
 		 547 aa  388  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  42.45 
 
 		 498 aa  388  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  42.48 
 
 		 514 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  41.18 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  44.6 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  41.41 
 
 		 547 aa  365  1e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  41.23 
 
 		 525 aa  365  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  39.46 
 
 		 520 aa  359  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  38.34 
 
 		 553 aa  320  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  38.51 
 
 		 499 aa  317  5e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  35.7 
 
 		 493 aa  264  4e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  34.29 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  32.61 
 
 		 453 aa  217  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  34.05 
 
 		 468 aa  217  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.6 
 
 		 452 aa  216  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 		 470 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  30.58 
 
 		 476 aa  213  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.58 
 
 		 449 aa  213  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  31.53 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  34.3 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  34.81 
 
 		 435 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  31.91 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  34.05 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 446 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  31.52 
 
 		 446 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  33.62 
 
 		 459 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  33.19 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  32.24 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  33.33 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  32.6 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  32.97 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  32.6 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  32.6 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  31.08 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  32.97 
 
 		 446 aa  198  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  32.03 
 
 		 446 aa  198  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  32.39 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  32.17 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.25 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  31.57 
 
 		 464 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  33.66 
 
 		 442 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  29.77 
 
 		 457 aa  196  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  31.69 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  29.72 
 
 		 454 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  31.28 
 
 		 518 aa  194  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  34.64 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  32.47 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  30.98 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.2 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  33.59 
 
 		 443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  32.84 
 
 		 488 aa  190  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  32.38 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  34.11 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  32.54 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  32.2 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  32.38 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  28.09 
 
 		 458 aa  186  6e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  32.03 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.21 
 
 		 455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  32.43 
 
 		 483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  31.47 
 
 		 486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  32.8 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  32.43 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  34.05 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  30.39 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>