245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2162 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  65.74 
 
 		 514 aa  635    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 517 aa  1014    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  64.91 
 
 		 505 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  54.23 
 
 		 508 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  54.23 
 
 		 508 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  55.39 
 
 		 508 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  54.02 
 
 		 508 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  54.23 
 
 		 508 aa  524  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  54.02 
 
 		 508 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  54.23 
 
 		 508 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  54.02 
 
 		 508 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  54.55 
 
 		 508 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  54.55 
 
 		 508 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  53.81 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  53.91 
 
 		 508 aa  511  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  52.12 
 
 		 547 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  54.79 
 
 		 547 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  52.24 
 
 		 520 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  53.86 
 
 		 525 aa  475  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  50.98 
 
 		 524 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  52.74 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  47 
 
 		 502 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  45.45 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  47.78 
 
 		 492 aa  435  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  45.51 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  45.22 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  43.43 
 
 		 510 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  43.56 
 
 		 488 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  44.79 
 
 		 488 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  43.96 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  43.41 
 
 		 499 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  43.47 
 
 		 486 aa  398  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  45.05 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  43.47 
 
 		 527 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  42.22 
 
 		 495 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  42.37 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  44.23 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  43.32 
 
 		 503 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  43.32 
 
 		 503 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  43.1 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  37.42 
 
 		 494 aa  346  5e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  39.28 
 
 		 498 aa  340  4e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  39.07 
 
 		 499 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  38.85 
 
 		 493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  37.57 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  33.26 
 
 		 476 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  37.72 
 
 		 431 aa  196  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  33.55 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.14 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  33.55 
 
 		 446 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  33.76 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  32.9 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  33.12 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  35.19 
 
 		 473 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  33.33 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.11 
 
 		 456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  33.33 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  32.63 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  32.69 
 
 		 446 aa  183  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  33.5 
 
 		 435 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  32.47 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  35.08 
 
 		 449 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  32.32 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  32.63 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  30.96 
 
 		 518 aa  182  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  38.03 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  31.91 
 
 		 470 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  30.21 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.32 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  30.46 
 
 		 450 aa  181  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  37.69 
 
 		 455 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  31.37 
 
 		 460 aa  180  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  35.38 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  30.51 
 
 		 461 aa  176  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  33.16 
 
 		 454 aa  176  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  29.15 
 
 		 454 aa  176  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  27.62 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  31.66 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  35.09 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.36 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  30.75 
 
 		 454 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0722  sodium:neurotransmitter symporter  31.38 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000150418  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  33.08 
 
 		 446 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  34.03 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  30.77 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  29.78 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  36.34 
 
 		 442 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  35.44 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  33.42 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  34.38 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  30.77 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  32.56 
 
 		 443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  33.51 
 
 		 469 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  33.42 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  33.78 
 
 		 460 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  31.68 
 
 		 468 aa  167  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  33.02 
 
 		 468 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  35.28 
 
 		 488 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  31.36 
 
 		 446 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>