245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1219 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  98.01 
 
 
503 aa  969    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
503 aa  987    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  98.61 
 
 
503 aa  976    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  57.35 
 
 
494 aa  552  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  47.52 
 
 
493 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  47.25 
 
 
492 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  46.3 
 
 
502 aa  435  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  46.78 
 
 
488 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  45.74 
 
 
488 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  46.62 
 
 
486 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  46.29 
 
 
527 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  45.77 
 
 
495 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  45.79 
 
 
498 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  46.41 
 
 
510 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  46.54 
 
 
499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  44.96 
 
 
502 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  45.89 
 
 
503 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  43.82 
 
 
506 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  40.64 
 
 
508 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  41.24 
 
 
508 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  40.84 
 
 
508 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  41.04 
 
 
508 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  42.07 
 
 
514 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  40.84 
 
 
508 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  42.12 
 
 
508 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  42.83 
 
 
497 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  40.56 
 
 
508 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  40.56 
 
 
508 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  40.64 
 
 
508 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  40.64 
 
 
508 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  42.86 
 
 
498 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  40.44 
 
 
508 aa  369  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  40.83 
 
 
498 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  43.32 
 
 
517 aa  359  6e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  41.03 
 
 
505 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  40.7 
 
 
525 aa  333  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  40.8 
 
 
520 aa  333  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  40.78 
 
 
524 aa  331  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  40.21 
 
 
547 aa  330  3e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  39.44 
 
 
547 aa  323  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  38.78 
 
 
502 aa  312  6.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  39.43 
 
 
499 aa  310  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  36.56 
 
 
553 aa  286  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  39.36 
 
 
493 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  36.98 
 
 
453 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  36.59 
 
 
476 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  40.11 
 
 
431 aa  217  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.49 
 
 
449 aa  213  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  35.15 
 
 
460 aa  212  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.93 
 
 
456 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.94 
 
 
452 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  32.76 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  32.33 
 
 
446 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  32.76 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  32.76 
 
 
446 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  32.62 
 
 
446 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  32.62 
 
 
446 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  33.19 
 
 
458 aa  196  8.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  32.33 
 
 
446 aa  196  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  32.47 
 
 
446 aa  196  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  32.82 
 
 
459 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  32.55 
 
 
446 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  30.92 
 
 
461 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  31.93 
 
 
443 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  33.2 
 
 
518 aa  195  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  31.5 
 
 
446 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  32.3 
 
 
437 aa  195  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  32.12 
 
 
446 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  31.01 
 
 
447 aa  190  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  31.01 
 
 
447 aa  190  5.999999999999999e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  37.4 
 
 
475 aa  189  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  31.01 
 
 
447 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  33.16 
 
 
484 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  32.51 
 
 
458 aa  188  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  30.79 
 
 
454 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  31.22 
 
 
473 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  29.89 
 
 
454 aa  187  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  33.49 
 
 
457 aa  186  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  34.25 
 
 
473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  32.26 
 
 
483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  36.6 
 
 
447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  30.83 
 
 
454 aa  184  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  31.8 
 
 
468 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  35.75 
 
 
442 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.58 
 
 
447 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  32 
 
 
457 aa  183  7e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  35.32 
 
 
447 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  31.96 
 
 
464 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  35.56 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  35.08 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  34.56 
 
 
452 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  31.82 
 
 
470 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47656  hypothetical protein  31.76 
 
 
1166 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0223254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  30.45 
 
 
486 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  30.93 
 
 
488 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  29.11 
 
 
453 aa  177  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  33.03 
 
 
446 aa  177  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  31.59 
 
 
446 aa  177  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  29.09 
 
 
454 aa  176  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  29.34 
 
 
472 aa  176  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>