245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1761 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  100 
 
 
498 aa  991    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  57.88 
 
 
492 aa  592  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  58.82 
 
 
488 aa  581  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  56.03 
 
 
486 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  55.01 
 
 
527 aa  551  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  56.69 
 
 
488 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  55.05 
 
 
499 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  54.26 
 
 
495 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  54.89 
 
 
498 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  52.69 
 
 
503 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  53.1 
 
 
502 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  47.97 
 
 
502 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  45.92 
 
 
493 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  47.46 
 
 
506 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  44.68 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  44.68 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  45.42 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  44.68 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  46.37 
 
 
510 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  44.68 
 
 
508 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  44.47 
 
 
508 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  44.47 
 
 
508 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  44.89 
 
 
508 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  44.47 
 
 
508 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  45.95 
 
 
497 aa  434  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  44.26 
 
 
508 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  44.26 
 
 
508 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  45.34 
 
 
505 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  44.89 
 
 
514 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  42.86 
 
 
503 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  40.97 
 
 
498 aa  385  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  42.42 
 
 
503 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  41.99 
 
 
503 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  44.23 
 
 
517 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  40.88 
 
 
524 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  41.99 
 
 
547 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  41.26 
 
 
525 aa  364  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  42.17 
 
 
494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  40.52 
 
 
502 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  41.12 
 
 
547 aa  353  5e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  39.51 
 
 
520 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  40.45 
 
 
499 aa  340  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  37.06 
 
 
553 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  37.55 
 
 
493 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  35.96 
 
 
461 aa  228  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  35.49 
 
 
453 aa  227  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  32.31 
 
 
476 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 
431 aa  213  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  32.16 
 
 
453 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 
449 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  31.94 
 
 
456 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  33.78 
 
 
484 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  33.11 
 
 
437 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  32.13 
 
 
468 aa  205  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  31.19 
 
 
464 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  32 
 
 
470 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  31.83 
 
 
462 aa  203  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  32.98 
 
 
488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  39.44 
 
 
475 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.94 
 
 
452 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  35.75 
 
 
446 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  35.93 
 
 
446 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  35.65 
 
 
446 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  35.65 
 
 
446 aa  196  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  35.65 
 
 
446 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.94 
 
 
455 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  35.38 
 
 
446 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  35.38 
 
 
446 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  35.65 
 
 
446 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  32.26 
 
 
454 aa  195  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  34.44 
 
 
446 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  31.63 
 
 
518 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  35.1 
 
 
446 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  35.1 
 
 
446 aa  194  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  31.6 
 
 
441 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  32.74 
 
 
458 aa  191  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  32.88 
 
 
446 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  31.4 
 
 
455 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  30.63 
 
 
486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  32.28 
 
 
473 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  30.82 
 
 
455 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  31.03 
 
 
459 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  30.8 
 
 
446 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  29.66 
 
 
452 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  31 
 
 
483 aa  187  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  32.27 
 
 
435 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  35.47 
 
 
443 aa  187  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  31.94 
 
 
457 aa  187  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  31.77 
 
 
470 aa  187  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  32.08 
 
 
461 aa  187  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  32.58 
 
 
460 aa  187  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  32.95 
 
 
453 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  32.02 
 
 
454 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  30.98 
 
 
458 aa  186  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  31.64 
 
 
457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  31.5 
 
 
436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  32.33 
 
 
464 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  32.52 
 
 
453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  31.97 
 
 
454 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0801  sodium:neurotransmitter symporter  33.02 
 
 
461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>