245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1026 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 499 aa  992    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  44.02 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  42.14 
 
 		 502 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  39 
 
 		 493 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  39.68 
 
 		 502 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  39.31 
 
 		 510 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  40.57 
 
 		 492 aa  362  8e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  38.85 
 
 		 508 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  38.85 
 
 		 508 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  38.65 
 
 		 508 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  38.85 
 
 		 508 aa  353  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  38.85 
 
 		 508 aa  353  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  38.85 
 
 		 508 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  38.85 
 
 		 508 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  38.65 
 
 		 508 aa  350  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  38.45 
 
 		 508 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  38.45 
 
 		 508 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  38.45 
 
 		 508 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  39.8 
 
 		 498 aa  346  7e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  38.11 
 
 		 506 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  39 
 
 		 488 aa  340  5e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  38.99 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  39.76 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  38.51 
 
 		 527 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  39.43 
 
 		 503 aa  330  4e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  37.45 
 
 		 495 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  39.07 
 
 		 517 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  39.22 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  36.2 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  38.81 
 
 		 503 aa  320  6e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  37.15 
 
 		 498 aa  319  9e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  37.5 
 
 		 505 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  37.4 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  36.78 
 
 		 499 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  36.64 
 
 		 486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  39.15 
 
 		 547 aa  310  5e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  35.64 
 
 		 503 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  38.07 
 
 		 547 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  37.06 
 
 		 525 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  36.05 
 
 		 524 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  34.67 
 
 		 520 aa  283  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  35.45 
 
 		 502 aa  279  8e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  35.62 
 
 		 553 aa  277  4e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  35.65 
 
 		 493 aa  242  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.63 
 
 		 452 aa  200  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  32.74 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47656  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1166 aa  193  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0223254  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  30.74 
 
 		 431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  32.33 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  30.46 
 
 		 518 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  32.46 
 
 		 460 aa  181  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  30.15 
 
 		 455 aa  181  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  32.07 
 
 		 449 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  30.18 
 
 		 454 aa  179  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  29.68 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  29.22 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  30.9 
 
 		 459 aa  178  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  30.94 
 
 		 468 aa  176  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  29.27 
 
 		 455 aa  176  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  28.01 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  31.2 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  30.57 
 
 		 437 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  27.77 
 
 		 457 aa  173  7.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  30 
 
 		 461 aa  173  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  27.1 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  32.2 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  32.65 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  32.65 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  28.6 
 
 		 458 aa  171  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  32.65 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  32.65 
 
 		 446 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  28.85 
 
 		 486 aa  170  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  32.85 
 
 		 446 aa  170  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  32.49 
 
 		 446 aa  170  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  32.06 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  32.39 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  32.13 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  32.13 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  34.3 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  30.63 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  31.88 
 
 		 446 aa  167  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  29.25 
 
 		 452 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  31.88 
 
 		 446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  29.61 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  28.89 
 
 		 456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  27.42 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  30.37 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  27.42 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  29.18 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  27.19 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  30.09 
 
 		 452 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08966  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 		 675 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  29.98 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  34.39 
 
 		 451 aa  159  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  28.32 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  32.46 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  27.07 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  30.82 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  29.76 
 
 		 464 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  27.79 
 
 		 454 aa  158  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>