236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47656 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47656  hypothetical protein  100 
 
 		 1166 aa  2377    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0223254  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47653  predicted protein  94.4 
 
 		 232 aa  432  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000124104  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08966  conserved hypothetical protein  33.04 
 
 		 675 aa  257  8e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  34.43 
 
 		 493 aa  201  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  33.49 
 
 		 498 aa  196  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  33.87 
 
 		 502 aa  190  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  31.76 
 
 		 503 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  31.63 
 
 		 502 aa  185  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  32.7 
 
 		 503 aa  184  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  32.31 
 
 		 503 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  32.61 
 
 		 495 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  31.13 
 
 		 494 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  33.02 
 
 		 498 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  33.78 
 
 		 499 aa  180  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  32.07 
 
 		 508 aa  179  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  33.42 
 
 		 508 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  33.33 
 
 		 508 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  32.76 
 
 		 488 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  33.33 
 
 		 508 aa  176  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  33.66 
 
 		 508 aa  175  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  33.91 
 
 		 508 aa  175  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  33.66 
 
 		 508 aa  175  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  33.91 
 
 		 508 aa  175  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  31.8 
 
 		 499 aa  174  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  32.61 
 
 		 486 aa  173  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  29.98 
 
 		 492 aa  172  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  32.86 
 
 		 508 aa  172  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  32.86 
 
 		 508 aa  172  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  31.89 
 
 		 488 aa  172  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  32.35 
 
 		 527 aa  171  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  33.17 
 
 		 508 aa  171  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  32.42 
 
 		 502 aa  171  7e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  31.28 
 
 		 503 aa  166  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  32.68 
 
 		 498 aa  165  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  31.54 
 
 		 520 aa  164  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  30.56 
 
 		 506 aa  164  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  31.94 
 
 		 524 aa  162  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  31.74 
 
 		 517 aa  161  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  31.71 
 
 		 510 aa  160  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  30.58 
 
 		 497 aa  158  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  32.35 
 
 		 514 aa  158  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  31.62 
 
 		 505 aa  157  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  31.39 
 
 		 547 aa  156  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  32.01 
 
 		 547 aa  154  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  30.04 
 
 		 461 aa  147  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  30.71 
 
 		 525 aa  142  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  30.02 
 
 		 553 aa  135  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  27.17 
 
 		 486 aa  125  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  27.32 
 
 		 458 aa  120  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  30.63 
 
 		 449 aa  120  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  31.63 
 
 		 448 aa  119  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  28.19 
 
 		 464 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  27.42 
 
 		 454 aa  115  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  28.12 
 
 		 455 aa  115  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  28.53 
 
 		 466 aa  114  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  27.44 
 
 		 470 aa  114  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  29.3 
 
 		 443 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  29.52 
 
 		 431 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  29.41 
 
 		 454 aa  112  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  27.44 
 
 		 455 aa  111  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  30.41 
 
 		 455 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  27.87 
 
 		 454 aa  110  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  26.87 
 
 		 454 aa  110  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  26.98 
 
 		 446 aa  109  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  28.53 
 
 		 457 aa  109  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  26.67 
 
 		 453 aa  108  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  30.54 
 
 		 475 aa  108  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  32.56 
 
 		 493 aa  108  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  25.99 
 
 		 486 aa  107  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  26.12 
 
 		 453 aa  107  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  25.87 
 
 		 458 aa  106  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  26.73 
 
 		 453 aa  106  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  27.42 
 
 		 483 aa  106  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  27.98 
 
 		 452 aa  106  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  29.38 
 
 		 447 aa  106  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  28.9 
 
 		 461 aa  105  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  29.62 
 
 		 450 aa  105  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  28.4 
 
 		 476 aa  104  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  26.35 
 
 		 447 aa  104  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  26.35 
 
 		 447 aa  104  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  29.62 
 
 		 450 aa  103  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  26.98 
 
 		 455 aa  102  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  27.51 
 
 		 453 aa  101  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  27.49 
 
 		 469 aa  101  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  27.66 
 
 		 446 aa  100  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  29.93 
 
 		 443 aa  100  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  27.01 
 
 		 446 aa  99.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  27.59 
 
 		 470 aa  99.8  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  27.36 
 
 		 446 aa  99.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  26.32 
 
 		 462 aa  99.4  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  27.01 
 
 		 446 aa  99.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  27.36 
 
 		 446 aa  99.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  27.36 
 
 		 446 aa  99.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  27.36 
 
 		 446 aa  99  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  27.36 
 
 		 446 aa  99  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  26.99 
 
 		 457 aa  98.6  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  26.2 
 
 		 484 aa  98.6  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  26.02 
 
 		 452 aa  98.6  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  28.5 
 
 		 452 aa  97.4  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  26.27 
 
 		 451 aa  97.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>