245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2498 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 502 aa  991    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  53.96 
 
 		 492 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  50.72 
 
 		 502 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  49.18 
 
 		 508 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  49.39 
 
 		 508 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  49.18 
 
 		 508 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  49.18 
 
 		 508 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  47.49 
 
 		 510 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  48.98 
 
 		 508 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  49.18 
 
 		 508 aa  498  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  48.98 
 
 		 508 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  49.18 
 
 		 508 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  48.9 
 
 		 506 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  48.5 
 
 		 508 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  48.7 
 
 		 508 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  47.6 
 
 		 508 aa  488  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  47.97 
 
 		 498 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  49.48 
 
 		 488 aa  482  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  47.25 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  47.11 
 
 		 493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  47.83 
 
 		 505 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  49.19 
 
 		 497 aa  457  1e-127  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  47.79 
 
 		 499 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  46.22 
 
 		 498 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  44.33 
 
 		 495 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  44.06 
 
 		 527 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  46.3 
 
 		 503 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  47 
 
 		 517 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  47.37 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  44.74 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  45.34 
 
 		 486 aa  428  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  45.88 
 
 		 503 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  45.27 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  43 
 
 		 498 aa  413  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  44.92 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  44.31 
 
 		 547 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  45.6 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  43.45 
 
 		 525 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  44.85 
 
 		 547 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  41.88 
 
 		 524 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  42.48 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  42.83 
 
 		 553 aa  362  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  39.64 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2977  sodium:neurotransmitter symporter  38.25 
 
 		 493 aa  299  7e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.483313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  37.03 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.82 
 
 		 476 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.42 
 
 		 452 aa  226  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  33.77 
 
 		 461 aa  226  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  34.42 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  34.73 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.46 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  34.91 
 
 		 458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  34.36 
 
 		 518 aa  216  7e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  35.27 
 
 		 449 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  34.07 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  33.91 
 
 		 460 aa  210  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  34.26 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  32.03 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  32.62 
 
 		 468 aa  202  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  30.84 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.85 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  33.56 
 
 		 441 aa  197  5.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  31.21 
 
 		 454 aa  197  5.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  31.12 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  30.62 
 
 		 450 aa  193  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  30.59 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  30.65 
 
 		 454 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  31.05 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.14 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  30.55 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  32.47 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  31.61 
 
 		 444 aa  190  7e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  31.4 
 
 		 444 aa  189  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  32.98 
 
 		 455 aa  189  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  33.24 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  31.1 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  30.4 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  32.13 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  30.04 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  29.79 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  30.21 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  31.28 
 
 		 448 aa  183  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  30.43 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  31.53 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  32.24 
 
 		 473 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  30.5 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  32.54 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  32.1 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  30.34 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47656  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1166 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0223254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  33.42 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  28.88 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  34.06 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  33.42 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  29.81 
 
 		 443 aa  177  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  29.37 
 
 		 455 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  30.57 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  28.4 
 
 		 484 aa  176  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  27.21 
 
 		 486 aa  176  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>