245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1580 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1580  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 518 aa  1026    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0955  sodium:neurotransmitter symporter  41.07 
 
 		 693 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  34.36 
 
 		 502 aa  216  7e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  30.77 
 
 		 493 aa  206  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.72 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  32.2 
 
 		 499 aa  202  9e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  32.52 
 
 		 492 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  32.95 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  30.16 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  29.11 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  29.11 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  30.05 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  29.11 
 
 		 508 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  32.17 
 
 		 468 aa  198  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  28.93 
 
 		 508 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  29.11 
 
 		 508 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1322  sodium:neurotransmitter symporter  31.43 
 
 		 569 aa  196  7e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420587 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  31.93 
 
 		 495 aa  196  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  28.93 
 
 		 508 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.47 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  28.93 
 
 		 508 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  28.93 
 
 		 508 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  28.75 
 
 		 508 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  33.2 
 
 		 503 aa  195  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  32.04 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  30.32 
 
 		 470 aa  193  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  30.62 
 
 		 488 aa  193  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  31.93 
 
 		 498 aa  193  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  36.21 
 
 		 452 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  33.05 
 
 		 503 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  31.28 
 
 		 527 aa  190  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  32.3 
 
 		 503 aa  190  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.45 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  30.98 
 
 		 494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  30.86 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  30.72 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  31.44 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  30.77 
 
 		 488 aa  183  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  30.9 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  30.22 
 
 		 486 aa  182  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  31.81 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  30.75 
 
 		 505 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 		 449 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  31.17 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  34 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  31.63 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  32.83 
 
 		 437 aa  178  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  31.17 
 
 		 454 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  30.8 
 
 		 502 aa  177  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  31.97 
 
 		 452 aa  177  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  29.9 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  30.93 
 
 		 459 aa  176  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  30.38 
 
 		 461 aa  176  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  30.21 
 
 		 464 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  33.03 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  31.51 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  32.39 
 
 		 517 aa  173  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  33.42 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  31.99 
 
 		 524 aa  173  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  32.86 
 
 		 520 aa  173  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  32.33 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  31.58 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  31.58 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  31.58 
 
 		 446 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  31.32 
 
 		 446 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  31.16 
 
 		 483 aa  172  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  29.27 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  31.55 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  29.42 
 
 		 514 aa  171  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  31.58 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  31.32 
 
 		 446 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  34.03 
 
 		 475 aa  171  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  31.32 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  31.05 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  31.32 
 
 		 446 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  33.79 
 
 		 473 aa  170  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  31.97 
 
 		 502 aa  169  8e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  31.05 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  31.05 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  31.32 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  30.28 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  29.13 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  31.22 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  36.07 
 
 		 461 aa  167  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  28.54 
 
 		 454 aa  166  8e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  29.98 
 
 		 466 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  30.06 
 
 		 447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  28.84 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  29.24 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  29.85 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  32.11 
 
 		 498 aa  164  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  28.12 
 
 		 458 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  30.46 
 
 		 499 aa  163  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0722  sodium:neurotransmitter symporter  30.36 
 
 		 492 aa  163  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000150418  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  28.87 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  29.57 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  30.19 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  32.51 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>