245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2054 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  73.67 
 
 		 452 aa  635    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 452 aa  877    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  55.41 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  53.02 
 
 		 457 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  55.83 
 
 		 452 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  50.56 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  56.29 
 
 		 461 aa  465  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  50.56 
 
 		 450 aa  463  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  53.42 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  58.93 
 
 		 453 aa  464  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  52.61 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  52.91 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  49.33 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  51.45 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  49.67 
 
 		 464 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  49.77 
 
 		 451 aa  423  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  48.81 
 
 		 461 aa  418  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  51.2 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  47.06 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  50.66 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  45.97 
 
 		 478 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  49.21 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  46.99 
 
 		 486 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  48.76 
 
 		 449 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  47.61 
 
 		 486 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  45.75 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  46.53 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  42.73 
 
 		 457 aa  363  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  43.96 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  45.2 
 
 		 459 aa  352  8.999999999999999e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  44.44 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  40.58 
 
 		 446 aa  348  8e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  43.6 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  42.44 
 
 		 455 aa  346  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  43.95 
 
 		 452 aa  346  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  40.4 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  40.89 
 
 		 446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  41.89 
 
 		 455 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  40.18 
 
 		 446 aa  343  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  40.18 
 
 		 446 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  40.18 
 
 		 446 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  39.96 
 
 		 446 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  39.96 
 
 		 446 aa  342  7e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  39.96 
 
 		 446 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  43.96 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  44.62 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  40.18 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  40.18 
 
 		 446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  42.89 
 
 		 450 aa  339  5e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  42.95 
 
 		 476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  40.71 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  43.76 
 
 		 446 aa  328  9e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  43.02 
 
 		 456 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  44.77 
 
 		 449 aa  323  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  39.04 
 
 		 453 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  40.85 
 
 		 459 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  42.47 
 
 		 461 aa  312  9e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  41.22 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  41.22 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  41.22 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  41.22 
 
 		 451 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  41.22 
 
 		 452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  38.57 
 
 		 456 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  41.22 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  40.41 
 
 		 451 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  39.27 
 
 		 454 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  40.54 
 
 		 452 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  44.39 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  45.19 
 
 		 448 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  42.2 
 
 		 475 aa  296  5e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  36.79 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  40.04 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  40.04 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  40.53 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  40.41 
 
 		 452 aa  289  9e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  39.82 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  39.6 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  39.6 
 
 		 445 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  39.6 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  39.6 
 
 		 445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  40.86 
 
 		 452 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  39.37 
 
 		 445 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  39.37 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  40.86 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  37.86 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  39.64 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  38.41 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  36.79 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  39.42 
 
 		 447 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  40 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.41 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  39.47 
 
 		 483 aa  275  9e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  37.31 
 
 		 484 aa  275  9e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  34.92 
 
 		 446 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  34.92 
 
 		 446 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  39.21 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  38.65 
 
 		 469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  41.11 
 
 		 468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  32.81 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  35.83 
 
 		 444 aa  270  5e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>