245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1391 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
436 aa  849    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  67.98 
 
 
435 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  63.45 
 
 
437 aa  547  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  48.83 
 
 
437 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  42.96 
 
 
441 aa  364  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  41.11 
 
 
448 aa  339  5e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  41.82 
 
 
447 aa  315  7e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  39.73 
 
 
464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  36.34 
 
 
438 aa  288  9e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0645  sodium-dependent tyrosine transporter  36.67 
 
 
437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1706  sodium/neurotransmitter symporter family protein  35.4 
 
 
437 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  32.89 
 
 
453 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.73 
 
 
453 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  34.48 
 
 
452 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1245  sodium:neurotransmitter symporter  33.1 
 
 
434 aa  229  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000515099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  34.88 
 
 
455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  35.32 
 
 
455 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  35.86 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1246  sodium:neurotransmitter symporter  33.18 
 
 
430 aa  216  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000125308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  34.63 
 
 
454 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  34.87 
 
 
446 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  32.3 
 
 
453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  35.48 
 
 
454 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  32.66 
 
 
470 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  38.48 
 
 
472 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  31.6 
 
 
469 aa  210  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.49 
 
 
453 aa  210  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  32.89 
 
 
446 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  31.82 
 
 
448 aa  209  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  34.08 
 
 
446 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  32.38 
 
 
450 aa  208  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  32.46 
 
 
446 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  32.65 
 
 
446 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  33.94 
 
 
443 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  32.43 
 
 
446 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  32.43 
 
 
446 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  32.81 
 
 
450 aa  207  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  32.43 
 
 
446 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  32.46 
 
 
446 aa  206  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  32.24 
 
 
446 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  31.8 
 
 
446 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
449 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  30.84 
 
 
502 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  32.27 
 
 
446 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  30.91 
 
 
499 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  34.21 
 
 
445 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  33.71 
 
 
476 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  33.99 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  33.99 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  30.57 
 
 
461 aa  201  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  35.06 
 
 
431 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  34.43 
 
 
445 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  34.43 
 
 
445 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  33.33 
 
 
483 aa  199  6e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  34.43 
 
 
445 aa  199  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  33.77 
 
 
445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  31.99 
 
 
465 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  33.77 
 
 
445 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  29.07 
 
 
468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  31.42 
 
 
484 aa  196  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  31.28 
 
 
459 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  26.87 
 
 
454 aa  196  6e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.64 
 
 
456 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  27.65 
 
 
458 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  33.19 
 
 
447 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  31 
 
 
454 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  31.11 
 
 
493 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  31.32 
 
 
450 aa  193  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  34.28 
 
 
447 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.03 
 
 
486 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  29.55 
 
 
495 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  31.75 
 
 
488 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  32.69 
 
 
460 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  31.68 
 
 
462 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  31 
 
 
492 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  37.7 
 
 
475 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  35.25 
 
 
464 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  32.49 
 
 
448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  30.75 
 
 
494 aa  190  4e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  31.24 
 
 
503 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  31.35 
 
 
446 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  31.35 
 
 
446 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  31.46 
 
 
527 aa  189  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  32.93 
 
 
451 aa  189  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  30 
 
 
458 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  30.86 
 
 
449 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  32.73 
 
 
464 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  31.58 
 
 
446 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  32.29 
 
 
461 aa  186  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.15 
 
 
486 aa  186  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  30.45 
 
 
498 aa  186  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  33.1 
 
 
445 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  34.91 
 
 
455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  30.39 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  31.07 
 
 
502 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  32.44 
 
 
466 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  33.64 
 
 
452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  31.55 
 
 
452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  30.51 
 
 
468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  32.04 
 
 
451 aa  183  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>