245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16470 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  100 
 
 		 447 aa  877    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  66.29 
 
 		 464 aa  585  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  50.23 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  43.31 
 
 		 437 aa  349  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  38.31 
 
 		 448 aa  332  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  41.63 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  40.5 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  41.82 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0645  sodium-dependent tyrosine transporter  40.9 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1706  sodium/neurotransmitter symporter family protein  40.23 
 
 		 437 aa  298  2e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  38.66 
 
 		 437 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1245  sodium:neurotransmitter symporter  37.44 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000515099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1246  sodium:neurotransmitter symporter  34.62 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000125308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  34.47 
 
 		 453 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  34.26 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  39.32 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.58 
 
 		 449 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  33.85 
 
 		 448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  34.09 
 
 		 486 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  35.54 
 
 		 459 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  36.27 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  32.6 
 
 		 450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  31.91 
 
 		 453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  37.53 
 
 		 451 aa  190  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  30.62 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  34.01 
 
 		 452 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.29 
 
 		 452 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  33.65 
 
 		 454 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  33.94 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  32.87 
 
 		 450 aa  187  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  34.16 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  33.77 
 
 		 476 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  32.52 
 
 		 443 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  36.02 
 
 		 473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  33.1 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  33.73 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  34.57 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  32.82 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  33.56 
 
 		 464 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  33.56 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  34.19 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2007  sodium:neurotransmitter symporter  37.36 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  32.27 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  32.13 
 
 		 450 aa  180  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  32.46 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  30.18 
 
 		 456 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  30.84 
 
 		 446 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  35.9 
 
 		 457 aa  179  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  36.54 
 
 		 488 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 		 452 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  33.57 
 
 		 470 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  32.24 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  32.49 
 
 		 448 aa  177  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  32.37 
 
 		 466 aa  177  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  30.77 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  36.74 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  30.67 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  33.49 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  33.86 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  32.27 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  30.34 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  36.03 
 
 		 457 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  31.03 
 
 		 446 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 		 460 aa  172  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  33.78 
 
 		 470 aa  172  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  31.5 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  31.26 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.29 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  31.5 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  31.53 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  29.98 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  31.03 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  29.95 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  27.94 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  31.03 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  28.85 
 
 		 469 aa  170  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  27.63 
 
 		 502 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  30.55 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  31.26 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  31.03 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  30.8 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  31.03 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  31.03 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  29.07 
 
 		 488 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  30.19 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  33.78 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  32.43 
 
 		 451 aa  167  5e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  33.25 
 
 		 451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 452 aa  166  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3893  sodium:neurotransmitter symporter  32.53 
 
 		 488 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  37.64 
 
 		 475 aa  166  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  31.49 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  29.07 
 
 		 503 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  32.87 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  32.75 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  32.34 
 
 		 454 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  32.34 
 
 		 454 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  32.34 
 
 		 454 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  31.8 
 
 		 474 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  33.88 
 
 		 431 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>