245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0300 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0460  sodium:neurotransmitter symporter  77.06 
 
 		 436 aa  640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  75.17 
 
 		 458 aa  690    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 		 452 aa  895    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  74.72 
 
 		 452 aa  673    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  66.22 
 
 		 454 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  66.44 
 
 		 454 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  66.44 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  66.22 
 
 		 454 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  66 
 
 		 454 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  52.52 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  48.21 
 
 		 454 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  50.34 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  49.89 
 
 		 454 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  49.89 
 
 		 449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  50.11 
 
 		 448 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  51.14 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  48.55 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  47.45 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  45.67 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  45.01 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.54 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  34.9 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  34.54 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.05 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.97 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  34.72 
 
 		 446 aa  223  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  31.96 
 
 		 450 aa  223  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  31.14 
 
 		 473 aa  222  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  31.47 
 
 		 450 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  34.24 
 
 		 456 aa  219  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  39.84 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  35.45 
 
 		 453 aa  216  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  33.33 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  36.68 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  31.96 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  33.49 
 
 		 473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  34.78 
 
 		 452 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.08 
 
 		 468 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  34.7 
 
 		 464 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  32.9 
 
 		 470 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  34.77 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  31.99 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  31.83 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  32.34 
 
 		 453 aa  203  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  31.39 
 
 		 486 aa  203  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  32.18 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  31.61 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  34.11 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  32.75 
 
 		 454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  33.12 
 
 		 460 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  30.62 
 
 		 453 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  29.68 
 
 		 461 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  32.31 
 
 		 458 aa  196  8.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  32.04 
 
 		 475 aa  196  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.07 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  30.42 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  32.15 
 
 		 458 aa  194  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  31.1 
 
 		 457 aa  194  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  31.06 
 
 		 454 aa  193  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  28.85 
 
 		 486 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  31.39 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  34.59 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  28.98 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  30.89 
 
 		 443 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  29.91 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  30.65 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  29.91 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  29.69 
 
 		 447 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  29.69 
 
 		 447 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  30.44 
 
 		 435 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  30.26 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  30.26 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  30.04 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  31.45 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  28.87 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  29.46 
 
 		 447 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  29.48 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  29.77 
 
 		 497 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  33.62 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  33.77 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  30.08 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  32.75 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  31.11 
 
 		 437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  30.25 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1503  cell division membrane protein FtsW/MrdB/SpoVE  30.92 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  31.24 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  29.53 
 
 		 446 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  29.53 
 
 		 446 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  30.56 
 
 		 461 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1292  sodium- and chloride-dependent transporter  30.13 
 
 		 458 aa  179  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.889918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  29.88 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  29.46 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  29.72 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  29.53 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  31.11 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  29.46 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  28.48 
 
 		 468 aa  177  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  28.76 
 
 		 502 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  29.31 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  28.81 
 
 		 457 aa  176  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>