245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2187 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  100 
 
 
450 aa  883    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  99.33 
 
 
449 aa  875    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  49.66 
 
 
446 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  49.21 
 
 
452 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  48.9 
 
 
452 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  46.83 
 
 
464 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  47.19 
 
 
470 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  44.8 
 
 
452 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4202  Sodium:neurotransmitter symporter  45.06 
 
 
478 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  43.37 
 
 
453 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  45.54 
 
 
452 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0756  Sodium:neurotransmitter symporter  43.13 
 
 
467 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  46.15 
 
 
467 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4514  sodium-dependent transporter, putative  43.78 
 
 
467 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  44.22 
 
 
450 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  44.52 
 
 
450 aa  373  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  44.49 
 
 
464 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0400  sodium:neurotransmitter symporter  48.75 
 
 
446 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  43.46 
 
 
461 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  42.08 
 
 
457 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  46.21 
 
 
455 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  46.09 
 
 
466 aa  362  9e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  43.62 
 
 
451 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  41.72 
 
 
486 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  46.15 
 
 
453 aa  359  6e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  42.95 
 
 
486 aa  358  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  39.65 
 
 
457 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  42.44 
 
 
461 aa  341  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  43.6 
 
 
454 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  42.25 
 
 
452 aa  336  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  41.23 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  38.34 
 
 
446 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  38.34 
 
 
446 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  38.57 
 
 
446 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  38.34 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  38.34 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  38.79 
 
 
446 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  38.34 
 
 
446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  38.57 
 
 
446 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  38.57 
 
 
446 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  38.34 
 
 
446 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  39.65 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3971  sodium:neurotransmitter symporter  39.58 
 
 
452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.385097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0741  sodium:neurotransmitter symporter  36.26 
 
 
463 aa  302  9e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.649809  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  36.26 
 
 
446 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  38.26 
 
 
453 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  38.63 
 
 
476 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  39.95 
 
 
443 aa  294  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0271  sodium/proline symporter  39.65 
 
 
463 aa  293  5e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639807  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  38.22 
 
 
450 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  40.77 
 
 
475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.78 
 
 
445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  37.78 
 
 
445 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  37.78 
 
 
445 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  37.56 
 
 
445 aa  285  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  37.78 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  37.78 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  37.56 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  37 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  35.82 
 
 
455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.1 
 
 
445 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  37.84 
 
 
447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  36.1 
 
 
455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  37.92 
 
 
445 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  38.52 
 
 
456 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  36.92 
 
 
465 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  37.69 
 
 
468 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  37.61 
 
 
447 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  34.21 
 
 
454 aa  274  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  35.57 
 
 
456 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  35.14 
 
 
446 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  35.14 
 
 
446 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  35.23 
 
 
454 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  38.96 
 
 
449 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  35.99 
 
 
459 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  35.88 
 
 
468 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 
453 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  37.16 
 
 
452 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  37.16 
 
 
451 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  37.16 
 
 
452 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  37.16 
 
 
452 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  37.16 
 
 
452 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  37 
 
 
451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  35.78 
 
 
470 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  37 
 
 
452 aa  259  9e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  38.01 
 
 
469 aa  259  9e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  35.7 
 
 
461 aa  258  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  36.42 
 
 
461 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  33.63 
 
 
458 aa  256  6e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  36.56 
 
 
460 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  37.44 
 
 
452 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  32.96 
 
 
457 aa  253  6e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  37.61 
 
 
452 aa  253  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  33.85 
 
 
484 aa  252  8.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  37.61 
 
 
452 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  34.32 
 
 
483 aa  251  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  37.3 
 
 
451 aa  249  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  33.71 
 
 
454 aa  250  5e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0092  sodium-dependent transporter, putative  34.32 
 
 
442 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  34.22 
 
 
450 aa  248  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>