More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3540 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3540  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3979  LysR family transcriptional regulator  98.71 
 
 		 309 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2594  LysR family transcriptional regulator  93.07 
 
 		 303 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  85.48 
 
 		 323 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0530  LysR family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546421  normal  0.717973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3662  LysR family transcriptional regulator  51.48 
 
 		 306 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6979  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5329  LysR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 301 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0884153  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4957  LysR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3410  LysR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0692441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4078  transcriptional regulator, LysR family  51.5 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0721  LysR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 326 aa  288  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  0.129513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4379  LysR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 301 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  51.22 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3287  transcriptional regulator, LysR family  47.47 
 
 		 299 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0475  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0415  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2363  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3361  transcriptional regulator, LysR family  54.05 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2922  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 305 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5755  transcriptional regulator, LysR family  44.77 
 
 		 311 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4978  transcriptional regulator, LysR family  49.67 
 
 		 305 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 344 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2818  LysR family substrate binding transcriptional regulator  41.38 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.987922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2905  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.05 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 306 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3339  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5851  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0577  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 301 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2030  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 305 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.34 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 303 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.48 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  40.77 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 301 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  35.54 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0459  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  37.2 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 324 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1980  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  41.91 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 298 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 415 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3212  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  36.57 
 
 		 435 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1591  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  34.6 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10120  LysR family transcription regulator  42.12 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385324  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 289 aa  199  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 289 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 334 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 334 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3390  transcriptional regulator, LysR family  42.07 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318019  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1618  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1558  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.39 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.525706  hitchhiker  0.00043239 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 324 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  34.39 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>